Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 AL121768.1-201ENST00000613917 2544 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 METTL15-201ENST00000303459 4068 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 RNU1-43P-201ENST00000365052 165 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 RNU6-316P-201ENST00000391027 107 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
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FOXQ1Q9C009 RNU6ATAC21P-201ENST00000408656 126 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
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FOXQ1Q9C009 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC5.71□□□□□ -1.5
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FOXQ1Q9C009 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC5.71□□□□□ -1.5
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FOXQ1Q9C009 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC5.71□□□□□ -1.5
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FOXQ1Q9C009 AL389915.2-201ENST00000454576 441 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC5.71□□□□□ -1.5
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FOXQ1Q9C009 CDH13-209ENST00000567109 8042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.71□□□□□ -1.5
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FOXQ1Q9C009 WDR72-203ENST00000557913 5900 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 CTBS-202ENST00000370630 6600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 DAAM1-202ENST00000395125 5806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
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FOXQ1Q9C009 NAT1-201ENST00000307719 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 KIF1B-204ENST00000377086 10669 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
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FOXQ1Q9C009 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
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FOXQ1Q9C009 DUTP5-201ENST00000406790 469 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 AC093162.1-201ENST00000419682 124 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
FOXQ1Q9C009 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
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