Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 MLIP-213ENST00000514921 5743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 ZNF645-201ENST00000323684 1519 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 DOPEY1-202ENST00000349129 8210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 ZNF780B-202ENST00000434248 8665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 ZNF780B-207ENST00000617676 8664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 INTS6-220ENST00000497989 3022 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 STAG2-204ENST00000371157 5991 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 DEFB115-201ENST00000400552 267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AL451127.1-201ENST00000422909 624 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AL353748.1-201ENST00000440753 474 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AL161937.1-201ENST00000444478 425 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AP001434.1-201ENST00000444977 287 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 RPS29P33-201ENST00000456717 146 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 APOOP2-201ENST00000461561 539 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 ARHGEF3-AS1-201ENST00000477246 489 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AP000563.1-201ENST00000490865 758 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 LINC02198-201ENST00000504280 810 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC083795.2-201ENST00000510034 610 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 LINC02306-201ENST00000546412 529 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC078880.2-201ENST00000547948 843 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AL132712.2-201ENST00000556653 127 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 MIR7515HG-226ENST00000588330 1055 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 HSPE1P14-201ENST00000605812 302 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AC010857.1-201ENST00000606398 594 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 AL354821.1-201ENST00000617598 809 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 ZNF560-201ENST00000301480 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 PAN3-202ENST00000399613 4940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 NKRF-202ENST00000371527 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 UGT8-202ENST00000394511 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 DMXL2-203ENST00000543779 10400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
TRAPPC9Q96Q05 USP26-203ENST00000511190 3665 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 RPAP2-203ENST00000610020 16993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 DNAJC12-201ENST00000225171 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP191-201ENST00000362585 102 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP513-201ENST00000364648 118 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 MANSC4-201ENST00000381273 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AL357515.1-201ENST00000402967 542 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AL359378.2-201ENST00000415575 746 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 NUP35P2-201ENST00000416748 943 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 QRSL1P2-201ENST00000418582 964 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AL161618.1-201ENST00000438738 761 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 MTND1P16-201ENST00000465177 898 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TRAPPC9Q96Q05 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms