Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 OR2AT4-204ENST00000641593 8733 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 WDR17-201ENST00000280190 4705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 PPIAL4G-201ENST00000419275 3856 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 NFAT5-212ENST00000627621 5875 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 FAM135A-202ENST00000361499 5042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 NDUFS1-207ENST00000455934 3361 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 SERPINB7-207ENST00000546027 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 GAPDHP24-201ENST00000328713 983 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 LIPN-201ENST00000404459 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 AC073257.2-201ENST00000413991 528 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 AL353693.1-201ENST00000429567 442 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 IKZF2-209ENST00000442445 551 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 DARS-AS1-205ENST00000444649 558 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 TCEA1P1-201ENST00000449716 880 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 AP006216.2-201ENST00000457746 333 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 TRAPPC2-204ENST00000458511 678 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 AC112206.1-201ENST00000468416 477 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 RPS26P39-201ENST00000469206 341 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 RN7SL184P-201ENST00000488308 297 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 AC097460.1-204ENST00000515026 764 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 AC091987.1-201ENST00000517758 464 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 KCTD9P6-201ENST00000522306 950 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 IGHVIII-67-4-201ENST00000524281 296 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 NPM1P42-201ENST00000560329 862 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 BX323046.1-201ENST00000610145 535 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 AC025574.2-201ENST00000615621 514 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 SOX2-OT-255ENST00000630150 649 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 AC034229.2-201ENST00000566945 2508 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 LRRN3-201ENST00000308478 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 DLGAP5-202ENST00000395425 2954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 SCAPER-207ENST00000563290 5028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 ICE2-201ENST00000261520 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 PLCB4-201ENST00000278655 5430 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 CACNB4-229ENST00000636617 5757 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 MAGI2-222ENST00000636039 5671 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 AGTR1-205ENST00000461609 1545 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 FAM229B-201ENST00000368656 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 MEMO1-202ENST00000379383 1498 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 LIN7C-201ENST00000278193 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 LRRC49-201ENST00000260382 2784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 ZNF347-202ENST00000452676 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 PTPRO-210ENST00000544244 3978 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 LAMA2-201ENST00000421865 9640 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 NLRP8-201ENST00000291971 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 OFD1P17-201ENST00000437639 3018 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 AC106870.1-201ENST00000359823 200 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 TEX35-202ENST00000367639 785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 OR51A2-201ENST00000380371 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.6□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 RN7SKP59-201ENST00000410520 314 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 AL031674.1-202ENST00000413070 465 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 AL513365.2-201ENST00000423060 529 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 RPL7P57-201ENST00000423238 740 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 AL590999.1-204ENST00000430595 638 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 AL031123.1-201ENST00000432823 568 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 AL392089.1-202ENST00000444793 449 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 AL442647.1-201ENST00000449485 481 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 DNAJB5P1-201ENST00000454004 806 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 RANP1-206ENST00000455094 651 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 AC002075.1-201ENST00000457396 676 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 AC108693.1-201ENST00000496068 432 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 ANKRD36B-207ENST00000497329 649 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 BAALC-AS1-205ENST00000521102 613 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 AL049629.1-201ENST00000534431 648 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC6.6□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 AC114684.1-201ENST00000587659 352 ntTSL 3 BASIC6.6□□□□□ -1.35
NEDD1Q8NHV4 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109 ms