Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 OR8I1P-201ENST00000529291 931 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 AP002373.1-201ENST00000544347 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
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CCDC142Q17RM4 AC090695.1-201ENST00000561269 1222 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
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CCDC142Q17RM4 AC006270.3-201ENST00000605967 1036 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 OR8H2-203ENST00000641311 3092 ntAPPRIS P2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 CTAGE5-208ENST00000553352 3441 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
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CCDC142Q17RM4 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 SLC4A10-203ENST00000415876 5578 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 DPY19L2P2-203ENST00000435536 1858 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 GRAMD2B-210ENST00000511134 1577 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 DYNC2H1-201ENST00000334267 2984 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
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CCDC142Q17RM4 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
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CCDC142Q17RM4 MAST4-207ENST00000407621 559 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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CCDC142Q17RM4 PPP1R9A-201ENST00000289495 3983 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
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CCDC142Q17RM4 PDE10A-201ENST00000366882 8233 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
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CCDC142Q17RM4 LINC01249-201ENST00000412134 2663 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
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CCDC142Q17RM4 AC007382.1-201ENST00000624376 2618 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 RBBP6-202ENST00000348022 5739 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 RLIM-201ENST00000332687 8317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 SLAIN1-204ENST00000358679 2075 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 AL354685.2-201ENST00000448218 1447 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 OR5T3-202ENST00000313033 969 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC5□□□□□ -1.61
CCDC142Q17RM4 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
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