Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 AC090844.2-203ENST00000582263 632 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AC090403.1-204ENST00000582893 572 ntTSL 4 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 PPP3CB-AS1-206ENST00000595935 675 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 HCG18-243ENST00000602498 327 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 NANOGP3-201ENST00000605855 286 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AC079597.1-201ENST00000624306 508 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 GVQW2-203ENST00000641401 327 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 LINC01963-201ENST00000562038 3148 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 C12orf50-201ENST00000298699 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 UPF2-201ENST00000356352 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 DCN-202ENST00000393155 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 ADH4-207ENST00000505590 1400 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AC018809.2-201ENST00000602436 3823 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 LINC01478-201ENST00000587877 2068 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AL022344.1-201ENST00000439913 3965 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 ARHGEF9-229ENST00000637040 5001 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 PTPRD-214ENST00000540109 6210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AP005432.1-201ENST00000580891 3485 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AL592148.3-201ENST00000608771 2646 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 TNFSF4-202ENST00000367718 3429 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 LINC01630-202ENST00000578152 3188 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 MAK-204ENST00000536370 3767 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 CALCOCO2-204ENST00000448105 1916 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 ATF2-212ENST00000426833 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 DNAL1-202ENST00000553645 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 RN7SKP269-201ENST00000365545 319 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 RNA5SP122-201ENST00000384457 108 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 RPS20P15-201ENST00000412792 311 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 GNG12-AS1-202ENST00000414904 796 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AL021153.1-201ENST00000427360 308 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AC006335.2-201ENST00000437993 330 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AL591721.1-201ENST00000439849 751 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AC004691.1-201ENST00000440376 547 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 EEF1A1P1-201ENST00000447052 739 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 LINC01036-201ENST00000458683 858 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AC117430.1-201ENST00000474711 801 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AC093767.1-201ENST00000504523 156 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AC092673.1-201ENST00000510203 428 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 MTCO1P35-201ENST00000515270 228 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AC084768.1-201ENST00000518926 923 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 CDKN3-206ENST00000541304 1070 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
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ECM1Q16610 AC009117.1-201ENST00000563948 554 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 LINC02129-201ENST00000564381 692 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AC007342.4-202ENST00000565189 721 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
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ECM1Q16610 RNA5SP440-201ENST00000612665 119 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 5_8S_rRNA.1-201ENST00000614365 152 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AC090607.5-201ENST00000615692 224 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AC090527.3-201ENST00000619041 548 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 Metazoa_SRP.130-201ENST00000622625 267 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AC015871.5-202ENST00000623252 701 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 C1orf195-202ENST00000625027 441 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 POU2F2-219ENST00000625670 371 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AL355834.1-201ENST00000556602 3965 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 ZEB1-219ENST00000560721 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 TRPC4-201ENST00000338947 2912 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 DOCK4-AS1-201ENST00000452714 2494 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 PARD3B-214ENST00000622699 7442 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AL359922.3-201ENST00000624779 1670 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 PSG7-201ENST00000406070 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AC007681.1-201ENST00000604271 3438 ntTSL 4 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 NSF-206ENST00000575068 2667 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 RPL35AP24-201ENST00000413846 330 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AC010737.1-201ENST00000426699 559 ntTSL 2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AC108734.1-201ENST00000439549 399 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
ECM1Q16610 RN7SL72P-201ENST00000460697 269 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
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