Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 SRGAP1-201ENST00000355086 23331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 ZNF845-201ENST00000458035 4311 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 RNA5SP105-201ENST00000391123 113 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 Z86062.1-201ENST00000406773 777 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 AL358176.3-201ENST00000420757 454 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 AL357315.1-201ENST00000422930 254 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 AL589935.1-218ENST00000434683 529 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 GTF3AP5-201ENST00000442645 697 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 LINC01069-201ENST00000452933 546 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 CCDC75P1-201ENST00000469247 791 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 RPS27AP16-201ENST00000492222 470 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 TBCA-203ENST00000517679 545 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 AC007496.1-201ENST00000565641 739 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 RNF138P2-201ENST00000603490 592 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 AC015849.2-201ENST00000605738 409 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 UBE2Q2P2-203ENST00000613592 761 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 AC090617.9-201ENST00000623751 147 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 LINC00976-202ENST00000628064 534 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 ATF7IP2-201ENST00000324570 3396 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 ASNSP1-204ENST00000641977 1664 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 CPA3-201ENST00000296046 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 ERC1-222ENST00000589028 9202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 OR5AS1-202ENST00000641320 7860 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 ACKR4-201ENST00000249887 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 CNGA1-202ENST00000402813 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 SALL4P2-201ENST00000423288 2910 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 AL121657.1-201ENST00000327215 531 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 AL603910.1-201ENST00000423099 370 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 AL513174.1-201ENST00000423182 629 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 RPS29P17-201ENST00000430795 166 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 ARAFP2-201ENST00000440565 559 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 MTCO2P25-201ENST00000447065 681 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 EIF4A2P4-201ENST00000458691 1196 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 SETSIP-201ENST00000485873 879 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 RPSAP51-201ENST00000497462 645 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 AC096711.2-201ENST00000510592 454 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 RNU6-506P-201ENST00000516553 94 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 AMZ2-204ENST00000577273 895 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 LINC02073-202ENST00000592081 535 ntTSL 4 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 CRNDE-213ENST00000635991 546 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 NAV3-201ENST00000397909 9821 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 FCHSD2-208ENST00000458644 2215 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 CACNB4-245ENST00000637284 2423 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 IQCB2P-201ENST00000401788 1633 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 PLCZ1-206ENST00000538330 1612 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
NFIXQ14938 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.8 ms