Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC069366.1-201ENST00000583159 838 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC118757.1-201ENST00000586982 453 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC010127.1-205ENST00000595268 567 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC103792.1-201ENST00000603591 919 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AL133338.2-201ENST00000604292 736 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 IGKV2OR2-2-201ENST00000605025 300 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC092954.1-201ENST00000609121 445 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 UBE2NL-201ENST00000618570 1185 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 ABI3BP-201ENST00000284322 4498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 DDX18P5-201ENST00000534547 1306 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 JCHAIN-206ENST00000543780 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 MALRD1-204ENST00000454679 6880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 VIRMA-201ENST00000297591 6528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 RNA5SP509-201ENST00000364577 119 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 RPL23AP48-201ENST00000406913 488 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 LINC01646-201ENST00000420522 682 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 LIX1L-AS1-205ENST00000437797 536 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 USP9YP22-201ENST00000438971 294 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AL645638.1-201ENST00000440519 361 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 RRM2P4-201ENST00000441721 562 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 DUXAP8-207ENST00000456786 622 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 MTND4LP2-201ENST00000502312 285 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC104137.1-201ENST00000503625 385 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC016687.2-203ENST00000506650 578 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 IGLVIV-53-201ENST00000520107 367 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AL133304.2-201ENST00000546376 886 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC009558.2-201ENST00000558258 396 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 SULT1C2P1-202ENST00000562418 459 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 CCDC178-208ENST00000579916 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC008752.1-201ENST00000590046 408 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC008782.1-201ENST00000603386 430 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 ARF4P1-201ENST00000605447 541 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 DUXAP10-204ENST00000612052 616 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 LINC02211-204ENST00000642024 1070 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 LIX1-201ENST00000274382 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC004852.2-204ENST00000614137 1370 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC010300.1-201ENST00000600671 5134 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC012020.1-201ENST00000624541 1728 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 OR56B2P-202ENST00000641377 2453 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 PTPRC-201ENST00000348564 4626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 RNA5SP28-201ENST00000363841 119 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 RPL23AP47-201ENST00000408017 460 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 U3.35-201ENST00000408405 208 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AL133384.1-201ENST00000412744 351 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC093158.1-201ENST00000415549 791 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC108463.1-201ENST00000450258 347 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 RPL23AP44-201ENST00000482216 473 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
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