Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AC073071.1-201ENST00000412410 388 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AC108729.1-201ENST00000487812 947 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AC002094.2-201ENST00000577850 1121 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 LAMTOR5-AS1-203ENST00000585330 463 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 C2orf91-203ENST00000615044 393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AC105227.2-201ENST00000615075 605 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 MIR6864-201ENST00000617935 70 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 PDCD6IPP1-202ENST00000622242 1064 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 AK9-201ENST00000285397 2566 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
CHAF1AQ13111 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC5.34□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 GALNT11-203ENST00000422997 2371 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 XPO4-201ENST00000255305 9921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 OR5M3-202ENST00000641993 1400 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 MIR3065-201ENST00000390137 79 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 ATP5F1P2-201ENST00000398143 760 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 MFSD13B-201ENST00000420133 1290 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AL034347.1-201ENST00000420766 835 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AL009048.1-201ENST00000450437 298 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AL391427.1-201ENST00000451575 425 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 IFNWP4-201ENST00000453148 294 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AL132857.1-201ENST00000555180 708 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AL359237.1-202ENST00000556168 487 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AC012146.1-201ENST00000571138 462 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AC074237.1-201ENST00000577674 471 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AC008687.2-201ENST00000597865 520 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 RNU4-5P-201ENST00000607255 135 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AL138478.1-201ENST00000612252 832 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 PLEKHG7-203ENST00000638590 3267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 PIGN-229ENST00000638936 4233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AC016716.1-201ENST00000265882 708 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 RPL9-201ENST00000295955 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 HTN3-201ENST00000381057 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AL161909.1-201ENST00000397390 712 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 Z75741.2-201ENST00000417272 1167 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AC006076.1-201ENST00000423233 345 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 NANOGP5-201ENST00000424456 877 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 RAB11AP1-201ENST00000442978 646 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AC011037.1-201ENST00000483964 558 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 HMGB3P13-201ENST00000511263 607 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 MYLK-AS2-202ENST00000515464 754 ntTSL 2 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 SOD1P3-201ENST00000518682 454 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AC023442.2-201ENST00000526455 270 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 NAV2-AS1-201ENST00000526642 660 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 OR5BC1P-201ENST00000529327 739 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 MIR100HG-221ENST00000534297 572 ntTSL 4 BASIC5.32□□□□□ -1.56
CHAF1AQ13111 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC5.32□□□□□ -1.56
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