Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 AC118282.1-201ENST00000506408 765 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 AC093755.1-201ENST00000512950 1023 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 AC087808.1-201ENST00000520501 361 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 AC011586.1-201ENST00000521055 458 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 CTAGE1-202ENST00000525417 1267 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 OR5M7P-201ENST00000526140 972 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 AL109766.1-201ENST00000555080 552 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 FAM96A-206ENST00000559950 561 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 AC127502.1-204ENST00000564861 618 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 HNRNPCP4-201ENST00000571636 900 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 CCDC178-208ENST00000579916 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 AC234771.5-201ENST00000600161 514 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 AP000346.3-201ENST00000622821 210 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 GPR180-201ENST00000376958 8822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 KCNJ13-201ENST00000233826 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 LINC00901-201ENST00000487512 1452 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 MTRNR2L13-201ENST00000604093 1445 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 UGT2B7-201ENST00000305231 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 ADGRL2-203ENST00000370713 5382 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 CNTD1-205ENST00000588527 1308 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 IFNG-201ENST00000229135 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 DPRX-201ENST00000376650 648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 AC087276.2-201ENST00000394183 183 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 ERHP2-201ENST00000402323 299 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 HMGB1P49-201ENST00000418882 569 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 AC079790.1-201ENST00000420365 507 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 HMGB3P5-201ENST00000428894 612 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 IFNNP1-201ENST00000429219 553 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 ENOX1-AS2-201ENST00000434273 609 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 AL359878.2-201ENST00000435531 407 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 RPS20P21-201ENST00000466859 343 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 LINC02231-201ENST00000510459 447 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 AC096734.1-201ENST00000511279 1128 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 IFITM8P-201ENST00000522529 394 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 CD44-AS1-201ENST00000528869 587 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 AC118942.1-202ENST00000529081 578 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 RRAS2-205ENST00000529237 1278 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 AC068643.2-202ENST00000552759 622 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 AC023034.1-201ENST00000558141 518 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 LINC00511-212ENST00000581183 657 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
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PTP4A2Q12974 AC116651.1-201ENST00000609724 556 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 C8orf89-201ENST00000613105 495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 C1orf112-202ENST00000359326 4002 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 OR2AP1-202ENST00000641114 1548 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 LINC01187-201ENST00000506431 2314 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 OR6C3-201ENST00000379667 936 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 XKRYP1-201ENST00000423438 492 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 XKRYP2-201ENST00000432915 492 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 UBE2Q2P4Y-201ENST00000433767 207 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 AC241584.1-201ENST00000438469 1241 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 BMS1P22-202ENST00000440946 1160 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 AL591719.1-201ENST00000444669 744 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
PTP4A2Q12974 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
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