Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 SNORA51.8-201ENST00000384234 132 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 RNA5SP339-201ENST00000390987 122 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AL021331.1-201ENST00000402817 582 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 OR8G2P-201ENST00000412796 908 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AL591468.1-201ENST00000417932 573 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 LINC01389-201ENST00000420876 483 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 LINC01468-201ENST00000422763 570 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AL138760.1-201ENST00000423283 435 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 MTND2P5-201ENST00000432656 1006 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 OPA1-AS1-201ENST00000433105 492 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AC016292.1-201ENST00000438344 235 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 TDGF1P1-201ENST00000445734 527 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 PTCHD1-AS-201ENST00000455399 718 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AL589703.1-201ENST00000456032 256 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AL356270.1-201ENST00000456587 522 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 RN7SL385P-201ENST00000468873 276 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 MTND4LP2-201ENST00000502312 285 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AC116616.1-201ENST00000508815 366 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 RN7SKP265-201ENST00000516448 223 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AC105031.1-201ENST00000518550 476 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AC025437.5-201ENST00000522769 314 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AP005436.3-201ENST00000532849 572 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AC002563.1-201ENST00000535109 451 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AL133372.3-201ENST00000553082 821 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 RPL26-207ENST00000583011 524 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AC005324.5-201ENST00000584540 571 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 SRD5A3-AS1-204ENST00000592823 542 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AL136164.2-201ENST00000602823 732 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AL591926.2-202ENST00000615199 719 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 GXYLT1P4-203ENST00000616580 641 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AC010975.3-201ENST00000618727 978 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 VPS29-212ENST00000621131 1124 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 MUM1L1-202ENST00000357175 4173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 ZZZ3-202ENST00000370801 4328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 SOBP-204ENST00000618129 1550 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 RNU6-582P-201ENST00000362989 107 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
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FOXD4Q12950 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 TRGV8-201ENST00000390343 468 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
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FOXD4Q12950 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
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FOXD4Q12950 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AL161630.1-201ENST00000450938 1299 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
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FOXD4Q12950 AC024132.3-201ENST00000513616 649 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
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FOXD4Q12950 AC023632.1-201ENST00000518463 375 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 SAMD15-202ENST00000533095 412 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AL929601.2-201ENST00000549951 381 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AP005137.2-201ENST00000609238 400 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 Metazoa_SRP.181-201ENST00000616636 288 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 MUCL1-205ENST00000619042 243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AC022106.2-201ENST00000620114 757 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 ZFAND6-213ENST00000559835 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 OR12D1-207ENST00000514827 1712 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 PSG1-204ENST00000436291 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AL022393.1-201ENST00000625142 1677 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
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