Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 ATP2C1-202ENST00000359644 3401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
IFFO1Q0D2I5 CALCRL-203ENST00000410068 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
IFFO1Q0D2I5 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.82
IFFO1Q0D2I5 CASP1-210ENST00000528974 1402 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 AC096559.1-201ENST00000414086 399 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 MTND4P11-201ENST00000417020 1058 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 AL033504.1-201ENST00000427015 773 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 AL157400.3-201ENST00000449882 1298 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 SNORA64.4-201ENST00000516632 81 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 RAD21-203ENST00000517749 1003 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 PCAT1-201ENST00000519319 734 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 AC103952.1-201ENST00000521872 590 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 AP002892.1-201ENST00000537727 550 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 AC092902.2-202ENST00000599350 686 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 AC135803.1-201ENST00000608748 565 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 MIR6500-201ENST00000622700 86 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 AC116563.2-201ENST00000624751 535 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 TTN-AS1-263ENST00000627527 784 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 SNORA50A-202ENST00000629536 136 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 C8orf22-201ENST00000303202 1499 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 MNS1-201ENST00000260453 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 CYSLTR2-201ENST00000282018 4672 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 OR8G1-201ENST00000341493 936 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 SOD2P1-201ENST00000396543 562 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 OR8G2P-201ENST00000412796 908 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 RANP4-201ENST00000413361 655 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 AC106873.1-201ENST00000420664 459 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 DEFB122-201ENST00000433453 499 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 MTCYBP21-201ENST00000443300 1113 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 AC009495.2-201ENST00000457108 506 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 AC006463.2-201ENST00000473326 348 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 HMGB1P21-201ENST00000502313 581 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 AC010406.1-201ENST00000507948 555 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 AC097103.2-204ENST00000510068 569 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 RNU6-1308P-201ENST00000516817 103 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 OR4U1P-201ENST00000554958 912 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 MIR4277-201ENST00000578298 84 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 AP003117.1-201ENST00000602771 554 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 AL357559.1-201ENST00000622228 274 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 POU1F1-202ENST00000350375 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 DSG2-AS1-202ENST00000583706 2024 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 AL133270.1-201ENST00000402635 279 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 AC009505.1-201ENST00000413151 424 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 AC092652.1-202ENST00000413315 587 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 AL132796.1-201ENST00000421617 479 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 NDUFA5P10-201ENST00000432147 357 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 LMO7DN-IT1-201ENST00000436872 321 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 AC015971.1-202ENST00000439077 514 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 AL627224.1-201ENST00000448334 444 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 NUTF2P3-201ENST00000448540 384 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 AC021205.2-201ENST00000480069 347 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 RNU6-1004P-201ENST00000516584 111 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 AC008676.3-201ENST00000521237 435 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 LINC01609-202ENST00000522778 566 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 AC027804.1-201ENST00000534653 529 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 AL160191.1-201ENST00000555480 566 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
IFFO1Q0D2I5 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.4 ms