Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 LEUTX-202ENST00000638280 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 ZNF660-201ENST00000322734 5834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 ITCH-207ENST00000535650 2940 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 ALS2CR12-202ENST00000392257 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 STXBP4-202ENST00000398391 2160 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 PALMD-201ENST00000263174 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 ASTE1-208ENST00000514044 2504 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC087257.1-201ENST00000506925 2639 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 VDAC2P1-201ENST00000399358 958 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AL157378.1-201ENST00000424506 265 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC016831.4-201ENST00000438302 307 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AL033380.1-201ENST00000442781 421 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 PCBP1-AS1-237ENST00000452431 1194 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC002553.2-201ENST00000453217 340 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 LINC00377-201ENST00000456588 657 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AP000942.1-201ENST00000463969 747 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC010261.1-201ENST00000514411 457 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC008494.2-201ENST00000514544 370 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AP001330.2-201ENST00000523121 979 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC109462.2-201ENST00000558730 763 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 NDUFB4P11-201ENST00000560510 395 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC103876.1-201ENST00000568634 418 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 ROCK1P1-201ENST00000573767 549 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC022884.2-201ENST00000578535 580 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 VN1R92P-201ENST00000598511 928 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC234782.5-201ENST00000617723 324 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC244472.1-201ENST00000620773 347 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC099063.3-201ENST00000642066 185 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 SLCO1C1-201ENST00000266509 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC027228.2-201ENST00000567141 2154 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 LANCL1-204ENST00000441020 4503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 MRPL50-201ENST00000374865 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 PLCZ1-206ENST00000538330 1612 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 SYCP1-209ENST00000613524 3034 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 EIF2AK2-201ENST00000233057 10042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 RNU4-21P-201ENST00000362802 126 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC068538.1-201ENST00000376856 336 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 SNORA70.10-201ENST00000384515 134 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 SNORA11-201ENST00000408789 128 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 TPMTP3-201ENST00000411928 735 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 TMEM246-AS1-204ENST00000450109 538 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 RPL23AP56-201ENST00000460778 453 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC072039.1-201ENST00000477611 581 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 LINC02438-201ENST00000505347 641 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC093281.2-201ENST00000510153 597 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC091965.2-201ENST00000512324 613 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC022447.1-201ENST00000515358 464 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 TMEM68-206ENST00000519784 1009 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 LRRTM2-203ENST00000521094 1182 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC012339.2-201ENST00000523996 453 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 OR5AK1P-201ENST00000524837 922 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 LINC02553-201ENST00000529088 734 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC010196.1-201ENST00000550014 450 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 ATP5J2P6-201ENST00000565203 266 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
E2F1Q01094 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 191 ms