Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNU1-70P-201ENST00000362618 164 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TEX36-201ENST00000368821 922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL357075.1-201ENST00000404107 726 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PVALB-202ENST00000404171 422 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL024509.3-201ENST00000413898 745 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL7P10-201ENST00000417407 739 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL078581.1-201ENST00000419134 340 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CCNB1IP1P2-201ENST00000432876 818 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL627308.1-201ENST00000435693 821 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC016644.1-201ENST00000438553 434 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC004704.1-201ENST00000511219 583 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZCCHC10-210ENST00000513848 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00500-201ENST00000515860 539 ntTSL 4 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR4270-201ENST00000581799 70 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF630-AS1-201ENST00000614448 397 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR3653-201ENST00000625572 110 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PIGX-211ENST00000639474 777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RMDN2-204ENST00000406384 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TFPI-201ENST00000233156 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ANAPC10-201ENST00000309439 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORA31-201ENST00000362607 130 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL31P1-201ENST00000398116 372 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPL23AP27-201ENST00000415161 451 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC144530.1-201ENST00000452862 555 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC026355.2-201ENST00000456755 723 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS27AP1-201ENST00000475545 471 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005921.1-201ENST00000510589 286 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GMPSP1-201ENST00000514075 579 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC090150.2-201ENST00000521869 815 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ALG9-IT1-201ENST00000531305 684 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC007333.2-201ENST00000569998 559 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SATB1-AS1-207ENST00000593741 955 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 uc_338.1-201ENST00000612113 180 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CASC15-208ENST00000636388 1174 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC008703.1-201ENST00000637629 1174 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MACC1-202ENST00000400331 9159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MUC15-205ENST00000529533 2084 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DYDC1-202ENST00000372204 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RPS27AP11-201ENST00000402798 447 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC00446-201ENST00000414743 459 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DAB1-AS1-201ENST00000416598 1262 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC097467.3-223ENST00000417474 449 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNAJC19P7-201ENST00000428811 344 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC000124.1-201ENST00000448311 957 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
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