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| FXN | Q16595 | RNU6-97P-201 | ENST00000363387 | 104 nt | BASIC | 5.46 | □□□□□ -1.54 | | |
| FXN | Q16595 | RNY4P14-201 | ENST00000363656 | 96 nt | BASIC | 5.46 | □□□□□ -1.54 | | |
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| FXN | Q16595 | MIR188-201 | ENST00000385034 | 86 nt | BASIC | 5.46 | □□□□□ -1.54 | | |
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| FXN | Q16595 | LINC00969-332 | ENST00000630874 | 738 nt | TSL 5 BASIC | 5.46 | □□□□□ -1.54 | | |
| FXN | Q16595 | AC073488.6-201 | ENST00000632293 | 754 nt | BASIC | 5.46 | □□□□□ -1.54 | | |
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| FXN | Q16595 | C15orf41-212 | ENST00000567389 | 2618 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.46 | □□□□□ -1.54 | | |
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| FXN | Q16595 | ZNF571-203 | ENST00000451802 | 2265 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.46 | □□□□□ -1.54 | | |
| FXN | Q16595 | ZC3H12C-201 | ENST00000278590 | 8807 nt | TSL 2 BASIC | 5.46 | □□□□□ -1.54 | | |
| FXN | Q16595 | TRAPPC13-208 | ENST00000505553 | 1410 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 5.46 | □□□□□ -1.54 | | |
| FXN | Q16595 | MUC17-201 | ENST00000306151 | 14247 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.46 | □□□□□ -1.54 | | |
| FXN | Q16595 | CDK14-203 | ENST00000406263 | 5163 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 5.46 | □□□□□ -1.54 | | |
| FXN | Q16595 | RNF19A-205 | ENST00000519449 | 4330 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.46 | □□□□□ -1.54 | | |
| FXN | Q16595 | PDS5B-201 | ENST00000315596 | 7497 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.46 | □□□□□ -1.54 | | |
| FXN | Q16595 | GTPBP10-201 | ENST00000222511 | 7531 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.46 | □□□□□ -1.54 | | |
| FXN | Q16595 | GDA-209 | ENST00000545168 | 5362 nt | TSL 2 BASIC | 5.46 | □□□□□ -1.54 | | |
| FXN | Q16595 | PTPRT-201 | ENST00000356100 | 12480 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 5.46 | □□□□□ -1.54 | | |
| FXN | Q16595 | PTPRT-203 | ENST00000373187 | 12453 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 5.46 | □□□□□ -1.54 | | |
| FXN | Q16595 | SAGE4P-201 | ENST00000442271 | 3381 nt | BASIC | 5.46 | □□□□□ -1.54 | | |
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| FXN | Q16595 | LINC01541-202 | ENST00000568095 | 3105 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.45 | □□□□□ -1.54 | | |
| FXN | Q16595 | CD80-204 | ENST00000478182 | 1491 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.45 | □□□□□ -1.54 | | |
| FXN | Q16595 | SDAD1-203 | ENST00000395711 | 2513 nt | TSL 2 BASIC | 5.45 | □□□□□ -1.54 | | |
| FXN | Q16595 | CARF-208 | ENST00000428585 | 2513 nt | TSL 2 BASIC | 5.45 | □□□□□ -1.54 | | |
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| FXN | Q16595 | AC002525.1-201 | ENST00000624392 | 1622 nt | BASIC | 5.45 | □□□□□ -1.54 | | |
| FXN | Q16595 | RAPGEF4-213 | ENST00000535187 | 3707 nt | TSL 2 BASIC | 5.45 | □□□□□ -1.54 | | |
| FXN | Q16595 | KCNE2-201 | ENST00000290310 | 1051 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 5.45 | □□□□□ -1.54 | | |
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| FXN | Q16595 | RNA5SP258-201 | ENST00000362750 | 119 nt | BASIC | 5.45 | □□□□□ -1.54 | | |
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| FXN | Q16595 | RN7SKP292-201 | ENST00000365522 | 317 nt | BASIC | 5.45 | □□□□□ -1.54 | | |
| FXN | Q16595 | OR5V1-215 | ENST00000377154 | 1266 nt | APPRIS P1 BASIC | 5.45 | □□□□□ -1.54 | | |
| FXN | Q16595 | RAP1BP3-201 | ENST00000407180 | 549 nt | BASIC | 5.45 | □□□□□ -1.54 | | |
| FXN | Q16595 | RNU2-15P-201 | ENST00000410692 | 191 nt | BASIC | 5.45 | □□□□□ -1.54 | | |
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| FXN | Q16595 | MTND3P17-201 | ENST00000416968 | 344 nt | BASIC | 5.45 | □□□□□ -1.54 | | |
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| FXN | Q16595 | BTF3P10-201 | ENST00000433415 | 495 nt | BASIC | 5.45 | □□□□□ -1.54 | | |
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| FXN | Q16595 | AC110602.1-201 | ENST00000437414 | 318 nt | BASIC | 5.45 | □□□□□ -1.54 | | |
| FXN | Q16595 | AL121974.1-201 | ENST00000437859 | 377 nt | TSL 3 BASIC | 5.45 | □□□□□ -1.54 | | |
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| FXN | Q16595 | AL162419.1-201 | ENST00000440674 | 873 nt | TSL 1 (best) BASIC | 5.45 | □□□□□ -1.54 | | |
| FXN | Q16595 | LINC00366-201 | ENST00000441430 | 435 nt | TSL 2 BASIC | 5.45 | □□□□□ -1.54 | | |
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| FXN | Q16595 | AC113367.2-201 | ENST00000505749 | 160 nt | BASIC | 5.45 | □□□□□ -1.54 | | |
| FXN | Q16595 | AC112198.3-201 | ENST00000505950 | 441 nt | TSL 3 BASIC | 5.45 | □□□□□ -1.54 | | |
| FXN | Q16595 | AC008549.1-201 | ENST00000512900 | 643 nt | BASIC | 5.45 | □□□□□ -1.54 | | |
| FXN | Q16595 | Vault.3-201 | ENST00000516676 | 95 nt | BASIC | 5.45 | □□□□□ -1.54 | | |