Protein–RNA interactions for Protein: Q16595

FXN, Frataxin, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FXNQ16595 RNA5SP110-201ENST00000362638 115 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FXNQ16595 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FXNQ16595 RNY4P14-201ENST00000363656 96 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FXNQ16595 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FXNQ16595 MIR188-201ENST00000385034 86 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FXNQ16595 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AL589642.2-201ENST00000413291 839 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FXNQ16595 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AL136368.1-201ENST00000416249 401 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AL355357.1-201ENST00000433531 417 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FXNQ16595 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FXNQ16595 CNOT7P2-201ENST00000441051 832 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AP000281.1-201ENST00000444036 316 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FXNQ16595 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC096639.1-201ENST00000456240 347 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FXNQ16595 LINC01436-201ENST00000457157 1048 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FXNQ16595 ZFPM2-AS1-201ENST00000509144 542 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FXNQ16595 NPM1P41-201ENST00000512920 831 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FXNQ16595 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC091185.1-201ENST00000523840 528 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FXNQ16595 SPAG11B-207ENST00000528168 481 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FXNQ16595 LINC02313-201ENST00000553330 550 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FXNQ16595 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC107954.1-201ENST00000565906 727 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FXNQ16595 OR1E3-201ENST00000575608 948 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FXNQ16595 SLC25A36P1-201ENST00000590111 465 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC063977.5-201ENST00000601044 974 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FXNQ16595 UBE2E3-208ENST00000602632 446 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC145423.1-201ENST00000605712 336 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC004067.1-201ENST00000608733 700 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC010632.3-201ENST00000611377 369 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC006338.1-201ENST00000618453 749 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FXNQ16595 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FXNQ16595 LINC00969-332ENST00000630874 738 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC073488.6-201ENST00000632293 754 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FXNQ16595 C15orf41-212ENST00000567389 2618 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FXNQ16595 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FXNQ16595 RAPGEF4-215ENST00000540783 3974 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FXNQ16595 ZNF624-201ENST00000311331 4241 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FXNQ16595 ZNF571-203ENST00000451802 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FXNQ16595 ZC3H12C-201ENST00000278590 8807 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FXNQ16595 TRAPPC13-208ENST00000505553 1410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FXNQ16595 MUC17-201ENST00000306151 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FXNQ16595 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FXNQ16595 RNF19A-205ENST00000519449 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FXNQ16595 PDS5B-201ENST00000315596 7497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FXNQ16595 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FXNQ16595 GDA-209ENST00000545168 5362 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FXNQ16595 PTPRT-201ENST00000356100 12480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FXNQ16595 PTPRT-203ENST00000373187 12453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
FXNQ16595 SAGE4P-201ENST00000442271 3381 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
FXNQ16595 RASSF8-201ENST00000282884 1994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
FXNQ16595 LINC01541-202ENST00000568095 3105 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FXNQ16595 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FXNQ16595 SDAD1-203ENST00000395711 2513 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FXNQ16595 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FXNQ16595 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC002525.1-201ENST00000624392 1622 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FXNQ16595 RAPGEF4-213ENST00000535187 3707 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FXNQ16595 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FXNQ16595 OR1D2-201ENST00000331459 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FXNQ16595 RNA5SP258-201ENST00000362750 119 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FXNQ16595 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FXNQ16595 RN7SKP292-201ENST00000365522 317 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FXNQ16595 OR5V1-215ENST00000377154 1266 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FXNQ16595 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FXNQ16595 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FXNQ16595 HSD17B7P1-201ENST00000412419 1017 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FXNQ16595 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FXNQ16595 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC013429.2-201ENST00000418798 781 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AF064858.3-201ENST00000419664 509 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC069213.2-201ENST00000420238 366 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC130360.1-201ENST00000425489 1117 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FXNQ16595 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FXNQ16595 BTF3P10-201ENST00000433415 495 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FXNQ16595 GAPDHP59-201ENST00000435908 267 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC110602.1-201ENST00000437414 318 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AL121974.1-201ENST00000437859 377 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC012368.1-201ENST00000438115 552 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
FXNQ16595 LINC00366-201ENST00000441430 435 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AL645936.1-201ENST00000441979 518 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC010733.1-201ENST00000451515 401 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FXNQ16595 RPL15P21-201ENST00000495592 567 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC008629.2-201ENST00000503783 483 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC113367.2-201ENST00000505749 160 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC5.45□□□□□ -1.54
FXNQ16595 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
FXNQ16595 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.3 ms