Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 RNU6ATAC28P-201ENST00000459249 118 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 RPL7P15-201ENST00000461190 712 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 RPS7P7-201ENST00000463499 571 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 RPL7P39-201ENST00000481157 744 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 TM4SF1-AS1-201ENST00000484046 488 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 RPL23AP72-201ENST00000492447 435 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 PRB1-202ENST00000500254 775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC105384.2-201ENST00000508433 640 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 PCAT4-202ENST00000514836 373 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC112191.2-201ENST00000522428 333 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 LINC02384-208ENST00000546086 565 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AL358335.2-201ENST00000555693 487 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 CENPUP2-201ENST00000555897 1186 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC092078.1-201ENST00000558370 325 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 PWRN1-202ENST00000562501 642 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 ALOX12P2-208ENST00000574183 519 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC025857.2-201ENST00000602711 238 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 RDM1-226ENST00000619828 687 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 PCDH11X-202ENST00000361655 4126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 ZNF280B-201ENST00000613655 3714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 CFH-201ENST00000359637 1454 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 CD80-204ENST00000478182 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 ELF2P3-201ENST00000445099 1506 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 ALCAM-205ENST00000472644 4189 ntTSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 ERVW-1-201ENST00000493463 2925 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 PTPRD-202ENST00000356435 9472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 ZNF559-ZNF177-201ENST00000434737 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 DSC2-202ENST00000280904 12325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC025574.1-201ENST00000554784 1653 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC048341.2-201ENST00000550290 8693 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 ATP2C1-210ENST00000505330 4888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 FAM170B-AS1-203ENST00000442525 2000 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC025470.1-201ENST00000510053 2032 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AL138820.1-201ENST00000617901 5305 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 IGLV4-3-201ENST00000390318 403 ntAPPRIS P1 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 RPL11P3-201ENST00000395256 523 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 OR7E101P-201ENST00000400428 513 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 RN7SKP229-201ENST00000410465 302 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 RNU2-15P-201ENST00000410692 191 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 RN7SKP286-201ENST00000410894 299 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AL133482.1-201ENST00000415988 498 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC126120.1-201ENST00000431082 470 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 UBE2V1P13-201ENST00000436983 439 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AL807757.1-201ENST00000437846 424 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 RGS5-217ENST00000451759 835 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AL589765.1-201ENST00000457548 386 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC117386.2-202ENST00000472821 522 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 RN7SL57P-201ENST00000493687 290 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC083795.2-201ENST00000510034 610 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC114781.3-201ENST00000512083 142 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC139365.2-201ENST00000517972 253 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AP005357.1-201ENST00000520749 476 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC107918.3-201ENST00000533272 382 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AP000763.3-201ENST00000542598 334 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC007225.2-201ENST00000562529 256 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AP005380.1-201ENST00000584896 547 ntTSL 4 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 SUGT1P3-202ENST00000604259 383 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 AC079776.5-201ENST00000641920 211 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 ZNF418-212ENST00000616958 2212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
PDCD1Q15116 CBX5-201ENST00000209875 11528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
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