Protein–RNA interactions for Protein: Q15080

NCF4, Neutrophil cytosol factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCF4Q15080 SUCNR1-201ENST00000362032 4181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.8□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 LINC00630-205ENST00000440496 2101 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 FAM126B-202ENST00000418596 9333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 OR51F1-201ENST00000380383 960 ntAPPRIS P5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 AC105402.1-201ENST00000413336 545 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 AC091493.1-201ENST00000426218 411 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 AL121718.1-201ENST00000449463 387 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 HMGB1P26-201ENST00000452520 628 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 MTND3P6-201ENST00000485242 339 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 TRAV11-201ENST00000539512 339 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC3.79□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC3.79□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.79□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 FAM49B-230ENST00000639004 837 ntTSL 5 BASIC3.79□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC3.79□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC3.79□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 KNTC1-201ENST00000333479 6975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 WDR49-201ENST00000308378 2594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 ZNF616-201ENST00000330123 2563 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 PGBD4P8-201ENST00000412993 562 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 AC007390.1-201ENST00000415722 356 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 HRH4-202ENST00000426880 909 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 AC096638.2-201ENST00000434965 711 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 AC097103.2-204ENST00000510068 569 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 AC099805.1-203ENST00000518177 773 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 NARSP2-201ENST00000518524 679 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 AC005225.1-201ENST00000553394 937 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 AC141257.3-201ENST00000572906 215 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 MIR5047-201ENST00000579212 100 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 AC107982.3-201ENST00000584957 985 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 AC104662.1-201ENST00000604448 511 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 AC084036.1-201ENST00000609190 508 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 AC125613.1-204ENST00000636224 1248 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 METTL8-218ENST00000638989 876 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 METTL8-219ENST00000640734 726 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC3.78□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.8
NCF4Q15080 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.78□□□□□ -1.81
NCF4Q15080 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
NCF4Q15080 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
NCF4Q15080 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
NCF4Q15080 RNU6-185P-201ENST00000384421 107 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NCF4Q15080 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NCF4Q15080 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NCF4Q15080 HMGB3P19-201ENST00000403971 560 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NCF4Q15080 MTHFD2P2-201ENST00000407725 247 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NCF4Q15080 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
NCF4Q15080 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
NCF4Q15080 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
NCF4Q15080 CYCSP43-201ENST00000438233 310 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NCF4Q15080 AL353743.2-203ENST00000443630 492 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
NCF4Q15080 AL355601.1-201ENST00000444701 427 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
NCF4Q15080 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC3.77□□□□□ -1.81
NCF4Q15080 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
NCF4Q15080 AC007688.1-201ENST00000475592 759 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
NCF4Q15080 AL139099.1-201ENST00000497398 403 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.5 ms