Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AL691449.1-201ENST00000426570 421 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AC096638.2-201ENST00000434965 711 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 HCG2040054-201ENST00000435331 434 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 RANP8-201ENST00000444720 713 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
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DDX39BQ13838 AL121718.1-201ENST00000449463 387 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
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DDX39BQ13838 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 NUDT6-203ENST00000502270 678 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
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DDX39BQ13838 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
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DDX39BQ13838 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AC079328.3-201ENST00000558905 691 ntTSL 3 BASIC3.83□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AC051619.4-201ENST00000560034 292 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC3.83□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC3.83□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AC011477.2-201ENST00000590697 921 ntTSL 2 BASIC3.83□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AC006116.9-201ENST00000591630 649 ntTSL 5 BASIC3.83□□□□□ -1.8
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DDX39BQ13838 AC004775.1-201ENST00000607389 753 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
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DDX39BQ13838 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.83□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AC104446.1-201ENST00000613728 1321 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AL627171.1-201ENST00000618845 1308 ntBASIC3.83□□□□□ -1.8
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DDX39BQ13838 GAPDHP36-201ENST00000480688 918 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
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DDX39BQ13838 AC097372.3-201ENST00000503593 522 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
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DDX39BQ13838 SNORA48.9-201ENST00000516419 162 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 LINC01609-201ENST00000519506 424 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 PIH1D2-208ENST00000532211 1103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AC016134.1-201ENST00000565259 701 ntTSL 3 BASIC3.82□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 ZRANB2-AS2-212ENST00000590186 686 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 ZEB2-AS1-204ENST00000595109 855 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AC004160.1-210ENST00000599875 689 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 MIR378J-201ENST00000611988 109 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 C1orf185-204ENST00000612209 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.82□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 MIR6716-201ENST00000613413 80 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC3.82□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC3.82□□□□□ -1.8
DDX39BQ13838 AC024595.1-201ENST00000623088 387 ntBASIC3.82□□□□□ -1.8
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