Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 BBX-204ENST00000406780 3674 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
PICALMQ13492 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
PICALMQ13492 DTNA-203ENST00000315456 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PICALMQ13492 CDK14-203ENST00000406263 5163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PICALMQ13492 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PICALMQ13492 LRRC9-202ENST00000445360 4717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PICALMQ13492 KLRC1-201ENST00000347831 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PICALMQ13492 LRP1B-201ENST00000389484 16535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PICALMQ13492 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PICALMQ13492 CAPZA3-201ENST00000317658 1087 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PICALMQ13492 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PICALMQ13492 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PICALMQ13492 RNU4-28P-201ENST00000364739 141 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PICALMQ13492 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PICALMQ13492 Y_RNA.465-201ENST00000384293 102 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PICALMQ13492 RNU6-441P-201ENST00000384545 106 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PICALMQ13492 ZNF603P-201ENST00000405613 487 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PICALMQ13492 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PICALMQ13492 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PICALMQ13492 RPS20P14-201ENST00000412545 360 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PICALMQ13492 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PICALMQ13492 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PICALMQ13492 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PICALMQ13492 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PICALMQ13492 LINC01318-201ENST00000423593 597 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PICALMQ13492 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PICALMQ13492 AC005345.1-201ENST00000431868 217 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PICALMQ13492 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PICALMQ13492 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PICALMQ13492 AC084149.1-201ENST00000437233 284 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PICALMQ13492 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PICALMQ13492 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PICALMQ13492 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PICALMQ13492 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PICALMQ13492 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PICALMQ13492 SNORA48.10-201ENST00000516965 160 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PICALMQ13492 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PICALMQ13492 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PICALMQ13492 ARL2BPP5-201ENST00000523141 481 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PICALMQ13492 MTCO2P15-201ENST00000532655 656 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PICALMQ13492 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PICALMQ13492 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PICALMQ13492 AL359219.2-201ENST00000555184 348 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PICALMQ13492 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PICALMQ13492 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PICALMQ13492 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PICALMQ13492 BPIFA4P-203ENST00000603168 689 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PICALMQ13492 AP000569.1-201ENST00000607953 591 ntTSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PICALMQ13492 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PICALMQ13492 ATXN3-251ENST00000617719 1074 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PICALMQ13492 uc_338.13-201ENST00000618243 179 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PICALMQ13492 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PICALMQ13492 AC000123.2-201ENST00000623124 461 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PICALMQ13492 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PICALMQ13492 MYBPC1-208ENST00000547405 3834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PICALMQ13492 LINC02426-201ENST00000550506 1372 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
PICALMQ13492 MAPK6PS3-201ENST00000403865 2162 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PICALMQ13492 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
PICALMQ13492 MTRNR2L7-201ENST00000544824 1535 ntAPPRIS P1 BASIC5.28□□□□□ -1.56
PICALMQ13492 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 DTNA-231ENST00000598774 2418 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 RPS26P8-201ENST00000393490 348 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 RPL23AP38-201ENST00000423801 469 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 AL357520.1-201ENST00000441557 453 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 LINC00456-201ENST00000453862 692 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 RPL5P24-201ENST00000463742 885 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 AC020890.1-201ENST00000491837 504 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 HMGB3P16-201ENST00000508037 287 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 AC022784.3-202ENST00000517816 826 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 AC055720.2-201ENST00000537724 172 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 RAP1B-224ENST00000541216 701 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 AC091117.2-201ENST00000560324 542 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 AGGF1P8-201ENST00000562979 1000 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 AC107952.2-201ENST00000606048 486 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 AL008729.1-201ENST00000606627 553 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 AC079395.3-201ENST00000615161 484 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
PICALMQ13492 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.2 ms