Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 MT-ND4L-201ENST00000361335 297 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 RNU1-77P-201ENST00000390868 162 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 SNRPEP2-201ENST00000397592 279 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 DBIP1-201ENST00000401435 260 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 AL133388.1-201ENST00000404509 287 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 AL136131.1-201ENST00000406079 803 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 SNX10-203ENST00000409367 746 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 RAD23BP1-201ENST00000421404 1227 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 TXNDC12-AS1-201ENST00000428794 391 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 HSPD1P12-201ENST00000429127 1069 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 RPL31P35-201ENST00000431058 377 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 CYCSP6-201ENST00000434498 302 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 LINC01891-201ENST00000439798 538 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 SNRPGP6-201ENST00000451124 220 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 AC018638.3-201ENST00000461273 132 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 RPL23AP71-201ENST00000470966 469 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 AL161747.1-201ENST00000480068 358 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 CTD-2350J17.1-202ENST00000510456 360 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 LINC02223-202ENST00000511596 578 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 LINC00992-202ENST00000514186 564 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 AC040914.1-201ENST00000518674 318 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 HMGB1P40-201ENST00000525121 540 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 AC134775.1-201ENST00000531268 464 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 AC090022.1-201ENST00000546569 311 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 AL157394.1-201ENST00000562983 1224 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 LINC01904-201ENST00000564872 861 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 AC011824.2-202ENST00000578602 533 ntTSL 4 BASIC6.19□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 MIR4489-201ENST00000578869 62 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 AC024267.4-201ENST00000580782 683 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 AC011840.5-201ENST00000582125 771 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 RN7SL356P-201ENST00000582228 248 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 AC022916.4-201ENST00000585646 475 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 AC073254.1-207ENST00000600482 714 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 AL391646.1-201ENST00000603860 190 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 AC011816.2-201ENST00000607089 556 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 AC112250.2-201ENST00000609450 491 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 Z95327.3-201ENST00000610385 572 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 AL109811.3-202ENST00000612387 651 ntTSL 3 BASIC6.19□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 AC009093.5-201ENST00000620963 359 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 AC021106.3-201ENST00000623925 531 ntBASIC6.19□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 CGA-206ENST00000630630 832 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 OR11H4-203ENST00000641525 1082 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 OR10G4-203ENST00000641722 3301 ntAPPRIS P1 BASIC6.19□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 HHLA2-209ENST00000489514 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 LINC01152-201ENST00000472655 3578 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC6.19□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 IGF2BP2-AS1-202ENST00000456447 1531 ntTSL 1 (best) BASIC6.19□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 SETDB2-201ENST00000258672 2138 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC6.19□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 RALGAPA1-202ENST00000382366 6328 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 ARHGEF12-213ENST00000532993 8753 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 TGIF1-208ENST00000472042 2214 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 SLC26A7-210ENST00000617233 5257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 TLR5-205ENST00000540964 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 AC104964.3-201ENST00000606115 2860 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 GPR1-201ENST00000407325 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 SYNCRIP-204ENST00000616122 6764 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 FP236241.1-201ENST00000623374 7632 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 CU633967.1-211ENST00000624444 7628 ntTSL 1 (best) BASIC6.18□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 AL159174.1-202ENST00000425588 442 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 NANOGP6-201ENST00000429190 847 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 AL049749.1-201ENST00000430281 632 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 AC018865.1-201ENST00000433507 578 ntTSL 4 BASIC6.18□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 ATP5HP2-201ENST00000433885 485 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 AC099670.2-201ENST00000435130 321 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 REG1CP-206ENST00000447469 496 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC6.18□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 AC010235.1-201ENST00000450613 547 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC6.18□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 OR2AO1P-201ENST00000476497 403 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 CR383656.1-201ENST00000484916 377 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 LINC00903-201ENST00000497854 223 ntTSL 3 BASIC6.18□□□□□ -1.42
AP3B2Q13367 AC111000.3-201ENST00000508057 576 ntBASIC6.18□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.4 ms