Protein–RNA interactions for Protein: Q13263

TRIM28, Transcription intermediary factor 1-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 835 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM28Q13263 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 TRPM3-206ENST00000377097 554 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 RPL34P27-201ENST00000428810 349 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 SLC36A1-202ENST00000429484 977 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AC068491.2-201ENST00000438897 617 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AL357514.1-201ENST00000446322 488 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 COX6CP18-201ENST00000448769 222 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 GAPDHP39-201ENST00000481866 979 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 TAF8-207ENST00000482432 556 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AC093278.1-201ENST00000494700 600 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 GYPB-202ENST00000502664 521 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 RNA5SP116-201ENST00000516132 98 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AC012400.1-201ENST00000518452 381 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AC021393.1-201ENST00000531077 433 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 LINC02300-201ENST00000549742 665 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 DNAJC8P1-201ENST00000554535 372 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AC019322.1-201ENST00000571869 389 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 UBL5-207ENST00000590068 390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AC108479.2-201ENST00000617314 601 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AC135068.12-201ENST00000637370 931 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 KCNA2-209ENST00000639048 10836 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 PAICS-201ENST00000264221 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 NLRP11-204ENST00000592953 3077 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 PSG9-202ENST00000270077 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 CTAGE5-219ENST00000640607 4239 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 PDE4D-216ENST00000507116 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 NRCAM-210ENST00000425651 3915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 LINC00158-201ENST00000332587 1476 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 TEX26-201ENST00000380473 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 KCNJ15-201ENST00000328656 8399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 Z95114.1-201ENST00000624264 14574 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 PPP3R1-203ENST00000409752 851 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 FLJ27354-201ENST00000415584 788 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AL929288.1-201ENST00000426262 746 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 CYCSP11-201ENST00000436426 315 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AL645937.3-201ENST00000453647 936 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 SPRY4-AS1-205ENST00000514303 152 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AC093331.2-201ENST00000520459 677 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 NRG1-IT1-202ENST00000521463 742 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AP001360.2-201ENST00000534423 562 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 LDHC-203ENST00000535809 757 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 LDHC-205ENST00000537486 583 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AP000786.1-201ENST00000541092 581 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AL390334.1-201ENST00000556395 450 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AC110588.1-201ENST00000559699 137 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AC009027.1-201ENST00000604510 479 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AC244472.2-201ENST00000617639 406 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AC099654.6-201ENST00000636487 512 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AP000550.3-201ENST00000637734 379 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 ITCH-201ENST00000262650 3089 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 KCNJ16-202ENST00000392670 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 SYNJ2BP-201ENST00000256366 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 SNX10-202ENST00000396376 2491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 AC020656.2-201ENST00000613291 5309 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 SSH1-202ENST00000326495 13040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 EIF4E-203ENST00000450253 11523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
TRIM28Q13263 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
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