Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 MUC15-204ENST00000527569 1386 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC007390.2-201ENST00000606229 3803 ntBASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 PLCL1-203ENST00000437704 5979 ntTSL 1 (best) BASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 SYT14-206ENST00000537238 5208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.38□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 PAPOLA-202ENST00000392990 2588 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 RN7SKP227-201ENST00000364445 330 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 SNORA71.2-201ENST00000364941 134 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 TEX35-205ENST00000367643 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 CARD16-201ENST00000375704 613 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AL590762.2-201ENST00000395798 571 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AL080315.1-201ENST00000406055 466 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AL023807.1-201ENST00000407932 359 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 MTCO2P8-201ENST00000412213 658 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 OR51B3P-201ENST00000412287 913 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 KRR1P1-201ENST00000419430 803 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 USP12PY-201ENST00000427677 1064 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 MOB1AP1-201ENST00000430903 535 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 KCND3-IT1-201ENST00000439736 376 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 OR10R1P-201ENST00000441524 1141 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 TBX18-AS1-202ENST00000441863 382 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 LINC01431-201ENST00000442440 514 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC104073.1-201ENST00000451988 151 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 MTCO3P2-201ENST00000457365 171 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 RPL21P126-201ENST00000470049 478 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC025164.1-201ENST00000496249 478 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC090673.1-204ENST00000504038 977 ntTSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 RHOBTB3-204ENST00000504179 883 ntTSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 LINC00977-201ENST00000509893 1163 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC007016.1-201ENST00000512110 244 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC138938.1-201ENST00000515431 782 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 OSGEPL1-AS1-203ENST00000523895 567 ntTSL 4 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 CARD16-203ENST00000525374 503 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC005868.1-201ENST00000536421 331 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 LINC01486-201ENST00000538041 716 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AP005121.1-201ENST00000578243 469 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC005412.1-201ENST00000580812 1049 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC069545.1-201ENST00000605671 358 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC007308.1-201ENST00000608856 373 ntTSL 3 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 OR5H6-201ENST00000615035 1113 ntAPPRIS P1 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC009237.17-201ENST00000618111 748 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 SCGB2A2-202ENST00000525380 1305 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 PCDH11X-207ENST00000406881 4156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 RAD17P1-201ENST00000418130 2042 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 TMEM106B-201ENST00000396667 12539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 TANK-206ENST00000406287 875 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC007435.1-201ENST00000421086 415 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 LINC01400-201ENST00000426358 947 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 SPINK8-201ENST00000434006 444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC007099.2-201ENST00000444852 336 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AL356421.2-201ENST00000446733 197 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC010618.1-201ENST00000469924 477 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC020898.1-201ENST00000474167 787 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 CDV3-208ENST00000511392 554 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 RNA5SP497-201ENST00000516081 97 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AP001189.2-201ENST00000527320 189 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 NUDT7-203ENST00000563839 316 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
CHAF1BQ13112 RN7SL339P-201ENST00000580597 296 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms