Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 ADAM29-201ENST00000359240 3325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 HMGB1-204ENST00000399489 1727 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 C5orf63-205ENST00000535381 5680 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 F2RL2-201ENST00000296641 3429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 HMGB1P5-201ENST00000255320 642 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 OR10J6P-201ENST00000289731 930 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 RNA5SP52-201ENST00000362448 134 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 WFDC6-202ENST00000372670 620 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 MIR153-1-201ENST00000384914 90 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 PSMA2P3-201ENST00000429685 675 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 BTF3P10-201ENST00000433415 495 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 AC108475.1-201ENST00000507880 950 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 AC087241.1-201ENST00000508615 429 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 KCTD9P2-201ENST00000512203 1013 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 NDUFB4P12-201ENST00000513465 390 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 RN7SKP277-201ENST00000516895 283 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 AC138701.1-201ENST00000524329 714 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 DEFB130C-202ENST00000530001 230 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 AC116003.2-201ENST00000579278 748 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 AL445567.2-201ENST00000618935 498 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 AL590227.1-201ENST00000622616 315 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 AC087821.2-201ENST00000637086 450 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 AL645568.2-201ENST00000432815 1337 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 LARP1BP1-201ENST00000506036 1359 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 ADGRL3-202ENST00000504896 4816 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 AC073130.1-201ENST00000457033 1958 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 IPO5-201ENST00000261574 6003 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 MTCO1P56-201ENST00000401674 224 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 ZNF603P-201ENST00000405613 487 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 OR4F13P-201ENST00000428478 931 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 ELL2P4-201ENST00000446870 1376 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 BX276092.4-201ENST00000452056 248 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 RNA5SP246-201ENST00000458909 119 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 AC010469.1-201ENST00000463864 576 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 C10orf128-207ENST00000474718 614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 AC069528.1-202ENST00000482888 637 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 AF213884.1-201ENST00000488102 463 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 AC120193.1-201ENST00000518988 741 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 DEFB109D-201ENST00000529497 240 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 LINC01479-202ENST00000546170 444 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 ZFAND6-208ENST00000558688 780 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 FAN1-202ENST00000561594 2738 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 ZNF230-204ENST00000585632 579 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 DYNAP-202ENST00000585973 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 AC119501.1-201ENST00000603646 475 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
HOXD13P35453 AL354760.1-201ENST00000608357 643 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
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