Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRMP28827 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRMP28827 MDM2-201ENST00000258148 1361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRMP28827 TNRC6B-202ENST00000335727 17933 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRMP28827 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRMP28827 CCNT1-205ENST00000618666 6915 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRMP28827 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRMP28827 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
PTPRMP28827 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPRMP28827 MRPS33P4-201ENST00000434892 317 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPRMP28827 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPRMP28827 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PTPRMP28827 AP005121.1-201ENST00000578243 469 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPRMP28827 AC002546.2-201ENST00000585537 584 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPRMP28827 AJ009632.2-205ENST00000635225 1169 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPRMP28827 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PTPRMP28827 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PTPRMP28827 RALGAPA1-204ENST00000553892 6271 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPRMP28827 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PTPRMP28827 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPRMP28827 STARD9-201ENST00000290607 15567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPRMP28827 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPRMP28827 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPRMP28827 NPM1P48-201ENST00000436002 853 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPRMP28827 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPRMP28827 AC000061.1-201ENST00000456270 376 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPRMP28827 SEPT14P1-201ENST00000458703 648 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPRMP28827 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPRMP28827 AK5-208ENST00000478255 556 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPRMP28827 RPL21P6-201ENST00000479171 504 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPRMP28827 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPRMP28827 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPRMP28827 AC103968.1-201ENST00000557841 573 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPRMP28827 AC092868.3-201ENST00000560515 784 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPRMP28827 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPRMP28827 AC091905.1-201ENST00000624400 311 ntBASIC5□□□□□ -1.61
PTPRMP28827 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
PTPRMP28827 ANKRD36C-202ENST00000456556 5428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPRMP28827 RAPH1-203ENST00000374493 3909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
PTPRMP28827 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRMP28827 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRMP28827 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRMP28827 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRMP28827 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRMP28827 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRMP28827 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRMP28827 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRMP28827 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRMP28827 KCNMB2-210ENST00000617329 2214 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRMP28827 RPL6P21-201ENST00000418672 846 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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PTPRMP28827 AP001207.2-201ENST00000519490 539 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
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PTPRMP28827 EIF4A2P3-201ENST00000525903 1055 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRMP28827 LINC00944-202ENST00000540684 888 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRMP28827 AC067852.3-201ENST00000589177 561 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRMP28827 MTUS1-216ENST00000519263 4089 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRMP28827 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRMP28827 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
PTPRMP28827 SMC2-AS1-201ENST00000603487 7020 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPRMP28827 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPRMP28827 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPRMP28827 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPRMP28827 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPRMP28827 AC004982.1-201ENST00000608770 1655 ntTSL 4 BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPRMP28827 OR51C1P-202ENST00000641159 1444 ntBASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPRMP28827 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
PTPRMP28827 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.98□□□□□ -1.61
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PTPRMP28827 TTC3-204ENST00000399017 10363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRMP28827 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRMP28827 AC011604.2-201ENST00000381541 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.97□□□□□ -1.61
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PTPRMP28827 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRMP28827 NDUFB9P3-201ENST00000521269 501 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRMP28827 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
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PTPRMP28827 AL390964.1-201ENST00000622486 845 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRMP28827 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRMP28827 AL022311.1-201ENST00000623726 19416 ntBASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRMP28827 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRMP28827 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRMP28827 OR6B1-202ENST00000641698 5153 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PTPRMP28827 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.61
PTPRMP28827 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
PTPRMP28827 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
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