Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 RN7SL722P-201ENST00000617780 284 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 RN7SL565P-201ENST00000618246 284 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 LINC01002-236ENST00000634022 378 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 OR52N4-202ENST00000641350 1276 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AL132640.2-201ENST00000559968 1698 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 CFAP70-201ENST00000310715 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 IL1RL1-201ENST00000233954 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 BTBD10P1-201ENST00000549824 1352 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 THAP6-202ENST00000380837 3423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 RNF111-212ENST00000561186 4536 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AL034370.1-201ENST00000397254 1590 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 ERMN-201ENST00000397283 3760 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 IQCH-202ENST00000358767 3062 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 PPP1R9A-207ENST00000433881 9928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 KLRC3-201ENST00000381903 798 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 PGBD4P8-201ENST00000412993 562 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 OR51A5P-201ENST00000415429 942 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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CCDC142Q17RM4 MTATP6P27-201ENST00000416987 621 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 MTCYBP38-201ENST00000417160 1123 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 GS1-594A7.3-201ENST00000421585 574 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 GHRL-209ENST00000446937 217 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AL365271.1-201ENST00000448909 603 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AC108463.1-201ENST00000450258 347 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AC008280.2-201ENST00000455473 307 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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CCDC142Q17RM4 AC108751.2-201ENST00000469993 231 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
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CCDC142Q17RM4 CCNG1-203ENST00000504553 732 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 MND1-203ENST00000504860 638 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 LINC02236-201ENST00000508881 552 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
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CCDC142Q17RM4 ZMYM6-201ENST00000317538 2702 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
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CCDC142Q17RM4 SYCP1-210ENST00000618516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 XIRP2-203ENST00000409195 12675 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 LPAR4-205ENST00000614823 2155 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 SGO1P2-201ENST00000429458 1589 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 SMG1P6-201ENST00000532337 2930 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 DAZ1-205ENST00000540248 3268 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 GPATCH2L-214ENST00000621494 12396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 CD84-206ENST00000368054 8181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 RC3H1-201ENST00000258349 10988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 SPINK5-201ENST00000256084 3535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 AC107027.3-201ENST00000565095 3473 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 CKS1B-201ENST00000308987 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 CCL20-201ENST00000358813 800 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 RNU1-83P-201ENST00000363426 164 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
CCDC142Q17RM4 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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