Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

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Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 RN7SL98P-201ENST00000462271 300 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 LINC01210-201ENST00000465283 625 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 LINC01327-201ENST00000498413 535 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 AP003066.2-201ENST00000529375 555 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 AC009396.1-201ENST00000553628 1079 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 OR11H7-201ENST00000553765 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 AC026992.1-202ENST00000558454 421 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 AC113403.1-201ENST00000604910 193 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 AP000255.1-201ENST00000610276 676 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 AC006338.2-201ENST00000616864 791 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 AL354821.1-201ENST00000617598 809 ntTSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 U73479.1-201ENST00000618062 168 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 MIR6758-201ENST00000620653 63 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 AC067931.1-201ENST00000624190 671 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 KIAA1524-208ENST00000625495 147 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 AC087521.4-201ENST00000637427 289 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 EMCN-209ENST00000511970 1377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 LINC01239-202ENST00000436786 2347 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 UTRN-204ENST00000367545 12339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 AL627171.1-201ENST00000618845 1308 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 C6orf10-207ENST00000533191 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 AC008033.1-201ENST00000216407 1162 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 RNU6-236P-201ENST00000363886 106 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 RNU1-130P-201ENST00000363930 160 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 AL121978.1-201ENST00000402778 359 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 MTCO3P31-201ENST00000405526 789 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
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SGCBQ16585 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 AC092638.1-201ENST00000411966 1275 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 P2RY10P2-201ENST00000416730 913 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 SFR1P2-201ENST00000421841 730 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 AL158840.1-202ENST00000425754 694 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
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SGCBQ16585 ARF4P4-201ENST00000439608 520 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 RPS23P7-201ENST00000466210 444 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 RPL5P23-201ENST00000496040 868 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 AC093801.2-201ENST00000503966 1050 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 AC112198.4-201ENST00000515450 351 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 MIR100HG-213ENST00000531470 560 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 AC091053.2-201ENST00000534169 537 ntTSL 4 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 AC135001.1-201ENST00000544546 283 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 AC004217.2-201ENST00000547401 751 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 AC012404.1-201ENST00000560876 476 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 AGGF1P8-201ENST00000562979 1000 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 AGGF1P6-201ENST00000569213 976 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 AL121834.1-201ENST00000572284 509 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 OR4G1P-201ENST00000588632 938 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 AC068620.3-201ENST00000602749 560 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 PDZPH1P-202ENST00000602846 722 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 AC079587.1-201ENST00000603846 277 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 AL390816.3-201ENST00000604527 1066 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 IL33-205ENST00000611532 757 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 AC244196.2-201ENST00000621184 411 ntAPPRIS P1 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 DLG2-AS1_1.1-201ENST00000622319 213 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 AC011944.2-201ENST00000624440 683 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 C8orf89-203ENST00000625134 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 CDH8-205ENST00000577730 8009 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
SGCBQ16585 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
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