Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 KIAA0586-209ENST00000556134 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.17□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.17□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 UGT2B10-202ENST00000458688 1424 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 TAS2R3-201ENST00000247879 1101 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 RNASE6-201ENST00000304677 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 PDC-201ENST00000391997 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 RNU6-55P-201ENST00000411092 107 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 RNU6-954P-201ENST00000411355 107 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 RPL31P45-201ENST00000419532 356 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 AL360093.1-201ENST00000420237 1126 ntTSL 1 (best) BASIC4.16□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 ARF4P2-201ENST00000430209 526 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 AL138759.1-201ENST00000432120 645 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 RPS20P32-201ENST00000456044 356 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 RPS3AP6-201ENST00000484430 795 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 RPS4XP15-201ENST00000489210 795 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 AC010255.1-201ENST00000504829 731 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 AC092440.1-201ENST00000512563 571 ntTSL 4 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 HMGB1P23-201ENST00000518743 568 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 AC073878.2-201ENST00000565449 385 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 LINC01081-201ENST00000597373 465 ntTSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 AL356515.1-201ENST00000611081 415 ntTSL 3 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 OR4A15-202ENST00000641526 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 RNF6P1-201ENST00000444889 1784 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.16□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC4.16□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC4.15□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 CXADR-205ENST00000400169 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.74
SYCP1Q15431 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 SNORA70C-201ENST00000384538 135 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 SPRR2A-201ENST00000392653 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 CCNB2P1-201ENST00000399411 1150 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 LINC01934-202ENST00000424170 686 ntTSL 4 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 AL353801.1-201ENST00000425541 425 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 SNORA71B-202ENST00000439232 272 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 RNU7-27P-201ENST00000459281 62 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 RPS7P7-201ENST00000463499 571 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 IGKV2-30-201ENST00000468494 390 ntAPPRIS P1 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 AC020898.1-201ENST00000474167 787 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 TMED11P-201ENST00000479478 690 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 RPL23AP73-201ENST00000492507 471 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 UBE2CP3-201ENST00000502715 450 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 LINC01088-203ENST00000507476 785 ntTSL 3 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 AP003117.1-201ENST00000602771 554 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 CCL14-203ENST00000620991 426 ntTSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC4.15□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC4.15□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.15□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 MCF2-203ENST00000370576 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 LRMP-221ENST00000636465 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 RPL26-201ENST00000293842 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 RN7SKP263-201ENST00000411194 309 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 SLC8A1-AS1-201ENST00000413479 800 ntTSL 5 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 LINC01754-201ENST00000437920 750 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 AL353898.1-201ENST00000444055 238 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 RPL7P19-201ENST00000469948 618 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 NPM1P17-201ENST00000479221 602 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 TXNP6-201ENST00000510190 310 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 AC007424.1-205ENST00000552615 579 ntTSL 4 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC4.14□□□□□ -1.75
SYCP1Q15431 AC120057.2-201ENST00000571520 271 ntBASIC4.14□□□□□ -1.75
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