Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 TUG1_1.1-201ENST00000610654 145 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.6□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 NMD3P1-201ENST00000439704 1488 ntBASIC5.6□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC5.6□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 RHOT1P2-201ENST00000366423 333 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 DPP10-AS3-201ENST00000417844 665 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 AL359634.1-201ENST00000429807 1179 ntTSL 5 BASIC5.59□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 MOB1AP1-201ENST00000430903 535 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC5.59□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 LINC01088-205ENST00000509088 756 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 AC093755.1-201ENST00000512950 1023 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 AC012409.1-201ENST00000560176 358 ntTSL 3 BASIC5.59□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 EIF1P6-201ENST00000600054 334 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 AL390838.2-201ENST00000602394 274 ntBASIC5.59□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.51
GAPVD1Q14C86 PTAR1-202ENST00000377200 9876 ntTSL 1 (best) BASIC5.59□□□□□ -1.52
GAPVD1Q14C86 MED4-AS1-201ENST00000422483 542 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GAPVD1Q14C86 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GAPVD1Q14C86 ATP5HP2-201ENST00000433885 485 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GAPVD1Q14C86 AC092447.2-201ENST00000435487 669 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GAPVD1Q14C86 AC092809.1-201ENST00000441469 474 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GAPVD1Q14C86 LINC01683-201ENST00000443479 412 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GAPVD1Q14C86 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GAPVD1Q14C86 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GAPVD1Q14C86 AC006557.5-201ENST00000603126 811 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GAPVD1Q14C86 MTRNR2L11-201ENST00000604646 1552 ntAPPRIS P1 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GAPVD1Q14C86 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GAPVD1Q14C86 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
GAPVD1Q14C86 AC096751.1-201ENST00000515178 2202 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
GAPVD1Q14C86 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GAPVD1Q14C86 ADAMTS9-AS1-207ENST00000594810 3609 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GAPVD1Q14C86 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
GAPVD1Q14C86 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
GAPVD1Q14C86 AL138885.1-201ENST00000405921 675 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GAPVD1Q14C86 RPL31P50-201ENST00000471002 296 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GAPVD1Q14C86 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
GAPVD1Q14C86 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
GAPVD1Q14C86 OR4R3P-201ENST00000525084 838 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GAPVD1Q14C86 SULT1C2P2-201ENST00000562517 294 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GAPVD1Q14C86 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
GAPVD1Q14C86 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
GAPVD1Q14C86 AC068254.2-201ENST00000623938 3577 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
GAPVD1Q14C86 F8-202ENST00000360256 9059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
GAPVD1Q14C86 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
GAPVD1Q14C86 HMMR-202ENST00000358715 2988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
GAPVD1Q14C86 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
GAPVD1Q14C86 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
GAPVD1Q14C86 OR6C1-201ENST00000379668 1064 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
GAPVD1Q14C86 MIR93-201ENST00000385024 80 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
GAPVD1Q14C86 LINC02505-203ENST00000515128 756 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
GAPVD1Q14C86 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
GAPVD1Q14C86 MS4A13-204ENST00000527948 790 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
GAPVD1Q14C86 MIR670HG-201ENST00000533531 897 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
GAPVD1Q14C86 AC022080.3-201ENST00000544433 482 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
GAPVD1Q14C86 DDX60L-209ENST00000511577 6781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
GAPVD1Q14C86 AFTPH-205ENST00000422803 1525 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
GAPVD1Q14C86 CNKSR2-202ENST00000379510 5315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
GAPVD1Q14C86 AL513175.1-201ENST00000431492 780 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
GAPVD1Q14C86 ATP5C1P1-201ENST00000441945 895 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
GAPVD1Q14C86 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
GAPVD1Q14C86 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
GAPVD1Q14C86 RNA5SP154-201ENST00000516193 111 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
GAPVD1Q14C86 AL355097.1-201ENST00000555889 539 ntTSL 4 BASIC5.56□□□□□ -1.52
GAPVD1Q14C86 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
GAPVD1Q14C86 AC005828.3-201ENST00000583552 591 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
GAPVD1Q14C86 AL137790.1-201ENST00000634283 177 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
GAPVD1Q14C86 ABCB5-201ENST00000258738 2906 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
GAPVD1Q14C86 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
GAPVD1Q14C86 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
GAPVD1Q14C86 C4orf33-202ENST00000425929 1588 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.56□□□□□ -1.52
GAPVD1Q14C86 DTNA-202ENST00000283365 6522 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
GAPVD1Q14C86 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
GAPVD1Q14C86 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
GAPVD1Q14C86 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
GAPVD1Q14C86 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GAPVD1Q14C86 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
GAPVD1Q14C86 EPGN-202ENST00000413830 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
GAPVD1Q14C86 AL139002.1-201ENST00000435281 902 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
GAPVD1Q14C86 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GAPVD1Q14C86 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GAPVD1Q14C86 AC099499.1-201ENST00000505040 558 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
GAPVD1Q14C86 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
GAPVD1Q14C86 SPINK13-203ENST00000512953 1022 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
GAPVD1Q14C86 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GAPVD1Q14C86 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GAPVD1Q14C86 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC5.55□□□□□ -1.52
GAPVD1Q14C86 AC244517.3-201ENST00000616254 1235 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
GAPVD1Q14C86 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
GAPVD1Q14C86 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
GAPVD1Q14C86 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GAPVD1Q14C86 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GAPVD1Q14C86 AL139413.1-201ENST00000421309 217 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GAPVD1Q14C86 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GAPVD1Q14C86 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
GAPVD1Q14C86 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
GAPVD1Q14C86 AC083923.2-202ENST00000517773 498 ntTSL 3 BASIC5.54□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.6 ms