Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AC092811.1-201ENST00000428642 397 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP140Q13342 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SP140Q13342 ACTR3P2-201ENST00000439585 1257 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SP140Q13342 DIAPH2-AS1-201ENST00000439759 971 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP140Q13342 TRIM31-AS1-204ENST00000440874 549 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AL161629.1-201ENST00000446201 457 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP140Q13342 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AC091180.1-201ENST00000462104 372 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SP140Q13342 RPL5P30-201ENST00000465511 891 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SP140Q13342 PRELID3BP7-201ENST00000503606 469 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SP140Q13342 MSMO1-203ENST00000504317 1026 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AC109830.1-202ENST00000515491 860 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP140Q13342 CDKL3-207ENST00000521755 586 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP140Q13342 C14orf105-210ENST00000534126 1030 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AC022367.1-202ENST00000535066 537 ntTSL 3 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP140Q13342 LINC02408-202ENST00000538573 559 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP140Q13342 GABARAPL1-212ENST00000543602 653 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP140Q13342 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP140Q13342 MIR3176-201ENST00000582210 90 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AC017100.2-201ENST00000584628 355 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AL512329.2-201ENST00000607350 548 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AC025588.4-201ENST00000615802 908 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AC072062.1-209ENST00000627336 772 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP140Q13342 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP140Q13342 CDC14A-206ENST00000635056 2056 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP140Q13342 OR8A1-203ENST00000641670 5709 ntAPPRIS P1 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP140Q13342 ALB-219ENST00000621085 1418 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP140Q13342 CXCL11-201ENST00000306621 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP140Q13342 MTERF1-202ENST00000406735 1639 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AC011493.1-201ENST00000596753 1632 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SP140Q13342 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AL031985.3-201ENST00000565390 2449 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SP140Q13342 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP140Q13342 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP140Q13342 TJP1-209ENST00000545208 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP140Q13342 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SP140Q13342 ATPAF1-212ENST00000542495 1779 ntTSL 2 BASIC5.04□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AC090017.1-201ENST00000548612 1779 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SP140Q13342 ZNF37BP-203ENST00000452306 1352 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
SP140Q13342 OR10A3-202ENST00000642047 2650 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SP140Q13342 PANDAR-201ENST00000629595 1506 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SP140Q13342 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SP140Q13342 FAT3-201ENST00000409404 19030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AC235565.1-201ENST00000456962 1325 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SP140Q13342 OR14L1P-202ENST00000641545 3009 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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SP140Q13342 AP000756.2-201ENST00000624168 2567 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SP140Q13342 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SP140Q13342 HNMT-201ENST00000280096 504 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SP140Q13342 IL3-201ENST00000296870 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
SP140Q13342 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
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SP140Q13342 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
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SP140Q13342 AC011377.1-201ENST00000517708 275 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AC087672.2-201ENST00000522498 429 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SP140Q13342 DEFB131D-201ENST00000526803 184 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SP140Q13342 OR4A45P-201ENST00000529954 901 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AC026401.1-201ENST00000549756 530 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SP140Q13342 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SP140Q13342 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SP140Q13342 CYCSP2-201ENST00000558168 301 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AC015871.2-201ENST00000603605 948 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SP140Q13342 TAS2R6P-201ENST00000605022 826 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
SP140Q13342 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
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