Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AL161631.1-201ENST00000417933 486 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 RBMY1KP-201ENST00000423480 476 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC011242.1-201ENST00000433596 1158 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC092625.1-201ENST00000442706 393 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 HSFY6P-201ENST00000445573 403 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 RPL6P5-201ENST00000445678 828 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 RPS27AP15-201ENST00000447672 466 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC020719.1-201ENST00000448977 518 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 SNAP25-AS1-205ENST00000453544 368 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 LINC01206-205ENST00000490001 949 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 PGRMC2-203ENST00000503588 818 ntTSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC105924.1-201ENST00000504057 339 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 ZKSCAN7P1-201ENST00000543668 673 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC007688.2-201ENST00000545158 369 ntTSL 3 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 ARL6IP1P1-201ENST00000545836 610 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC023394.1-201ENST00000578673 312 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC015911.9-201ENST00000591634 185 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC006116.5-201ENST00000591936 559 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 LINC00347-205ENST00000597518 868 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC024941.1-201ENST00000612250 334 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC084824.4-201ENST00000620106 731 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC007527.2-201ENST00000621825 546 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AL356121.2-201ENST00000624715 780 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 U6.107-201ENST00000637108 79 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 DLD-204ENST00000437604 1859 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 CASC19-261ENST00000641853 1638 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 DNAH6-201ENST00000237449 12666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AL365214.2-201ENST00000433684 1365 ntTSL 2 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 ZNF382-203ENST00000435416 3865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 KC6-201ENST00000592302 1713 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 MARK2P15-201ENST00000432204 2186 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 SCN3A-201ENST00000283254 9091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 NKTR-219ENST00000617821 7319 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 CNOT1-201ENST00000317147 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 OR2H1-202ENST00000377133 3021 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 PCDH15-214ENST00000395446 3948 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 LCOR-204ENST00000371103 10342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 TAS2R10-201ENST00000240619 1042 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 RNU5B-4P-201ENST00000363508 111 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 TRAV14DV4-201ENST00000390440 425 ntAPPRIS P1 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC096533.1-201ENST00000411645 353 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 TTTY17A-201ENST00000416110 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 UBTFL3-201ENST00000418934 1024 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 TCEA1P2-201ENST00000420496 906 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 RPL7P53-201ENST00000421245 739 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 TTTY17C-201ENST00000421387 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 VDAC1P6-201ENST00000430062 855 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 TTTY17B-201ENST00000441906 166 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 TVP23BP2-201ENST00000455082 615 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 PDZD9-203ENST00000537222 1068 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC117505.1-202ENST00000547027 566 ntTSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC084824.1-201ENST00000550917 1005 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC005537.1-201ENST00000588324 1238 ntTSL 1 (best) BASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC008759.1-201ENST00000589783 983 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 BNIP3P40-201ENST00000596017 556 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC099785.1-201ENST00000605697 437 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 FAM26D-205ENST00000628083 1117 ntTSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 MIR4496-201ENST00000635896 61 ntBASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 EMCN-209ENST00000511970 1377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.22□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.22□□□□□ -1.73
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