Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 RPGRIP1-201ENST00000382933 2004 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 ADAL-201ENST00000389651 1559 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 ARHGAP42P4-201ENST00000549782 2934 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 NBPF26-206ENST00000617913 2931 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AC037459.2-201ENST00000514980 4076 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 DOCK9-216ENST00000627024 4096 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 PCDH15-213ENST00000395445 5917 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 USP32-214ENST00000592339 4045 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AC244452.1-201ENST00000413798 141 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AC017078.1-201ENST00000416146 368 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AL356968.1-201ENST00000416622 474 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AL929472.1-201ENST00000417484 429 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 PVALB-204ENST00000417718 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 LINC01820-201ENST00000418415 570 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AC234781.4-201ENST00000419384 244 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 RPS17P17-201ENST00000419392 409 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AL158817.1-201ENST00000422310 933 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AL121885.3-201ENST00000422833 115 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 GSTA6P-201ENST00000424144 582 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AL391987.1-201ENST00000441025 200 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 DNAJC19P5-201ENST00000443295 316 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AL161621.1-201ENST00000444796 340 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 PCNPP5-201ENST00000452246 481 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AC079804.1-201ENST00000461922 436 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AC021382.1-201ENST00000483523 359 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 GM2AP2-201ENST00000491764 562 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AC111000.4-201ENST00000504301 569 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 MRPL36-203ENST00000505818 595 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 SCARNA21.2-201ENST00000516600 166 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AP003031.2-204ENST00000527219 567 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AC090651.1-201ENST00000567865 634 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AC012313.4-201ENST00000596296 495 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 LINC00310-205ENST00000609062 863 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AL121612.2-201ENST00000612261 482 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AC073488.6-201ENST00000632293 754 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 LINC01002-237ENST00000634025 555 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 HSD17B4-202ENST00000414835 2551 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AKAP17BP-201ENST00000431706 2719 ntBASIC6.23□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 MEF2C-AS1-214ENST00000514794 2350 ntTSL 4 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 PIRT-201ENST00000580256 3810 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 SGO1-AS1-205ENST00000634837 1677 ntTSL 5 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 GUCY1B2-203ENST00000493639 2871 ntTSL 1 (best) BASIC6.23□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 EZH1-222ENST00000592743 2501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 XPO1-202ENST00000404992 4105 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.23□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 SLAIN1-201ENST00000267219 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 ZSCAN5A-201ENST00000391713 3562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 LINC00598-215ENST00000638084 1974 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 MTPAP-201ENST00000263063 5601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 ZNF442-205ENST00000545749 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 NCOR1-205ENST00000395857 9501 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AP4E1-203ENST00000560508 6653 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AL050403.1-201ENST00000448859 2006 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 TXK-201ENST00000264316 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 VTRNA3-1P-201ENST00000362552 102 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 RNA5SP514-201ENST00000363717 111 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 RN7SKP62-201ENST00000384539 329 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AL359922.1-201ENST00000404796 935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 RNU4-25P-201ENST00000410569 230 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AC025946.1-201ENST00000413286 430 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 BX284656.2-201ENST00000414483 498 ntTSL 2 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 OSTCP4-201ENST00000424397 449 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AC083862.1-201ENST00000427378 1242 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 OR2AS1P-201ENST00000427827 319 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 VTCN1-204ENST00000430871 569 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AL035701.1-202ENST00000437249 371 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AC005487.1-201ENST00000440208 665 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AL034399.1-201ENST00000451535 380 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AC009963.3-201ENST00000458090 486 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 EPDR1-204ENST00000476620 555 ntTSL 4 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 LINC02025-201ENST00000488348 360 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 AC020893.1-201ENST00000502452 580 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
CLN3Q13286 HIGD1AP14-201ENST00000507617 282 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
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