Protein–RNA interactions for Protein: Q12950

FOXD4, Forkhead box protein D4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4Q12950 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 FABP7-202ENST00000368444 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 RNU6-730P-201ENST00000383954 104 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 RPL23AP26-201ENST00000412728 464 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 CRYBB2P1-203ENST00000415709 538 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 RPS7P15-201ENST00000415804 584 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AL451107.1-201ENST00000416310 408 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 C4BPAP2-201ENST00000428434 478 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 HSD52-202ENST00000436225 772 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC073648.4-201ENST00000442655 781 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AL732323.1-201ENST00000445897 456 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 PTGES3P5-201ENST00000455109 434 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 RPS3AP41-201ENST00000462701 778 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 NDUFA5P9-201ENST00000472609 340 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC005412.2-201ENST00000492004 341 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC105233.1-201ENST00000498840 781 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC011352.3-201ENST00000505162 593 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 MTCO2P32-201ENST00000514865 403 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 RNU6-1073P-201ENST00000517182 106 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 MTCO3P15-201ENST00000526563 574 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 NAV2-AS1-201ENST00000526642 660 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 PCNPP1-201ENST00000552501 511 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 FOPNL-208ENST00000575744 565 ntTSL 4 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC015845.2-201ENST00000581805 472 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC006116.5-201ENST00000591936 559 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC008814.1-201ENST00000603797 406 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC098935.2-201ENST00000604222 466 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC068787.1-201ENST00000623908 691 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC074099.1-201ENST00000634100 679 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 LINC01739-205ENST00000641890 573 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC017104.4-201ENST00000636283 1592 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 NUDT12-202ENST00000507423 1781 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
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FOXD4Q12950 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 SLC25A17-202ENST00000402844 2405 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 TRIM69-201ENST00000329464 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 AC009643.2-201ENST00000603543 1448 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
FOXD4Q12950 EIF2S1-202ENST00000466499 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
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FOXD4Q12950 ITCH-202ENST00000374864 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
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FOXD4Q12950 RNASE9-201ENST00000338904 1049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
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FOXD4Q12950 CENPW-203ENST00000368328 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
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FOXD4Q12950 AL078590.2-202ENST00000422736 568 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
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FOXD4Q12950 AL592494.1-201ENST00000437523 309 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
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FOXD4Q12950 AL589935.1-212ENST00000450998 525 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AC004872.1-201ENST00000456062 469 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
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FOXD4Q12950 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
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FOXD4Q12950 AC134050.1-201ENST00000495088 933 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AC104803.1-201ENST00000506917 529 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 MTCO3P44-201ENST00000510977 541 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 LINC00616-203ENST00000512536 568 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 PTH-202ENST00000529816 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
FOXD4Q12950 AP002765.2-201ENST00000532961 666 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
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