Protein–RNA interactions for Protein: C9JH25

PRRT4, Proline-rich transmembrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 899 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT4C9JH25 EMCN-201ENST00000296420 4037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PRRT4C9JH25 GPR85-201ENST00000297146 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PRRT4C9JH25 EIF4EBP2-201ENST00000373218 7257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PRRT4C9JH25 PTPRD-205ENST00000397611 8242 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PRRT4C9JH25 AL355306.2-205ENST00000635395 1646 ntTSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PRRT4C9JH25 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PRRT4C9JH25 ZEB1-205ENST00000446923 6267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PRRT4C9JH25 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PRRT4C9JH25 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC4.97□□□□□ -1.61
PRRT4C9JH25 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC4.97□□□□□ -1.61
PRRT4C9JH25 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.61
PRRT4C9JH25 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
PRRT4C9JH25 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
PRRT4C9JH25 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC4.96□□□□□ -1.61
PRRT4C9JH25 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.61
PRRT4C9JH25 SMG1P3-204ENST00000520823 3194 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.61
PRRT4C9JH25 ZNF836-204ENST00000597252 3209 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PRRT4C9JH25 SENP1-205ENST00000549595 1932 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PRRT4C9JH25 OR5AN1-201ENST00000313940 1037 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PRRT4C9JH25 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PRRT4C9JH25 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PRRT4C9JH25 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PRRT4C9JH25 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PRRT4C9JH25 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PRRT4C9JH25 AL121885.1-201ENST00000417957 451 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PRRT4C9JH25 OR2AH1P-201ENST00000425717 928 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PRRT4C9JH25 AL354977.2-201ENST00000430387 728 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PRRT4C9JH25 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PRRT4C9JH25 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PRRT4C9JH25 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PRRT4C9JH25 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PRRT4C9JH25 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PRRT4C9JH25 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PRRT4C9JH25 AC097262.1-201ENST00000452559 548 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PRRT4C9JH25 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PRRT4C9JH25 RAD51AP1P1-201ENST00000484195 1001 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PRRT4C9JH25 NIFKP7-201ENST00000503365 834 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PRRT4C9JH25 AC084024.2-201ENST00000503480 791 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PRRT4C9JH25 SCARNA22-201ENST00000503991 125 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PRRT4C9JH25 AC139718.1-201ENST00000508010 300 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PRRT4C9JH25 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PRRT4C9JH25 HHIP-AS1-203ENST00000512359 646 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PRRT4C9JH25 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PRRT4C9JH25 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PRRT4C9JH25 AC026904.2-201ENST00000521359 537 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PRRT4C9JH25 AC087379.1-201ENST00000524613 993 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PRRT4C9JH25 AP003181.1-201ENST00000528811 445 ntTSL 3 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PRRT4C9JH25 DERA-209ENST00000532964 854 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PRRT4C9JH25 OR6C73P-201ENST00000546432 358 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PRRT4C9JH25 AL133485.1-201ENST00000555966 392 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PRRT4C9JH25 ITFG1-AS1-202ENST00000565694 494 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PRRT4C9JH25 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PRRT4C9JH25 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PRRT4C9JH25 AC011503.1-202ENST00000598914 919 ntTSL 2 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PRRT4C9JH25 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PRRT4C9JH25 AC010738.1-201ENST00000604970 987 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PRRT4C9JH25 AC018695.5-201ENST00000605872 315 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PRRT4C9JH25 LAMTOR5-AS1-217ENST00000608152 407 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PRRT4C9JH25 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PRRT4C9JH25 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PRRT4C9JH25 Metazoa_SRP.193-201ENST00000622007 277 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PRRT4C9JH25 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PRRT4C9JH25 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PRRT4C9JH25 PIAS2-204ENST00000585916 11075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PRRT4C9JH25 AC004656.1-201ENST00000568479 4951 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PRRT4C9JH25 HEPHL1-201ENST00000315765 5345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PRRT4C9JH25 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PRRT4C9JH25 OR56A4-202ENST00000641156 3768 ntAPPRIS P1 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PRRT4C9JH25 TRIM36-209ENST00000514154 1952 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PRRT4C9JH25 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PRRT4C9JH25 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PRRT4C9JH25 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC4.96□□□□□ -1.62
PRRT4C9JH25 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PRRT4C9JH25 AC234781.1-202ENST00000412436 1329 ntTSL 5 BASIC4.96□□□□□ -1.62
PRRT4C9JH25 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PRRT4C9JH25 MTERF1-203ENST00000419292 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.96□□□□□ -1.62
PRRT4C9JH25 DNAJB4-201ENST00000370763 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PRRT4C9JH25 LIMA1-203ENST00000547825 3920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PRRT4C9JH25 SOX5-216ENST00000546136 6975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PRRT4C9JH25 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PRRT4C9JH25 RYR3-212ENST00000634891 15591 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PRRT4C9JH25 STIL-204ENST00000396221 4558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PRRT4C9JH25 TCF4-281ENST00000636822 7640 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PRRT4C9JH25 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PRRT4C9JH25 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PRRT4C9JH25 AL590240.1-201ENST00000334118 313 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PRRT4C9JH25 SNORA73.1-201ENST00000363107 205 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PRRT4C9JH25 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PRRT4C9JH25 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PRRT4C9JH25 RNA5SP332-201ENST00000391063 115 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PRRT4C9JH25 MIR298-201ENST00000401212 88 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PRRT4C9JH25 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PRRT4C9JH25 AL359633.2-201ENST00000415787 622 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PRRT4C9JH25 AC023347.1-202ENST00000419223 440 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PRRT4C9JH25 AC006960.1-201ENST00000419980 153 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PRRT4C9JH25 AC006333.1-201ENST00000422401 410 ntTSL 3 BASIC4.95□□□□□ -1.62
PRRT4C9JH25 AC019178.2-201ENST00000423595 505 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PRRT4C9JH25 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
PRRT4C9JH25 COX6CP15-201ENST00000426313 211 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
PRRT4C9JH25 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC4.95□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.5 ms