Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AC083899.3-201ENST00000603413 594 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 AC087385.3-201ENST00000620477 187 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 AC120349.2-201ENST00000625002 298 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 AC093495.1-217ENST00000627385 428 ntTSL 5 BASIC5.38□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 AC026634.1-201ENST00000634369 198 ntBASIC5.38□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 KCNAB1-205ENST00000471742 3301 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 CCDC91-201ENST00000381259 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 HEMGN-202ENST00000616898 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 NUP155-202ENST00000381843 4200 ntTSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 AKAP9-201ENST00000356239 12471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 ADAM29-203ENST00000445694 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 IPCEF1-203ENST00000422970 3267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC5.38□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 FAM81B-201ENST00000283357 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.55
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USP18Q9UMW8 ZBTB38-220ENST00000514251 7683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.37□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 CNTN1-202ENST00000348761 3328 ntTSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 KRR1-201ENST00000229214 10118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.37□□□□□ -1.55
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USP18Q9UMW8 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC5.37□□□□□ -1.55
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USP18Q9UMW8 ALCAM-207ENST00000486979 1818 ntTSL 5 BASIC5.37□□□□□ -1.55
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USP18Q9UMW8 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
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USP18Q9UMW8 ZBED6-201ENST00000545588 7979 ntTSL 1 (best) BASIC5.36□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 ERI2-202ENST00000357967 3499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 AC126755.2-208ENST00000327792 462 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 RPL21P132-201ENST00000331267 462 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
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USP18Q9UMW8 AC002524.1-201ENST00000411687 547 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 NPM1P40-201ENST00000412758 733 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 AC104462.2-201ENST00000418402 271 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 GNG5P5-201ENST00000420444 220 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 FSIP2-AS1-201ENST00000429929 440 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 ZDHHC20P1-204ENST00000435787 423 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 TMX2P1-201ENST00000436507 708 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC5.36□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 LINC01645-201ENST00000451341 491 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC5.36□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 RPL18AP17-201ENST00000455326 198 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
USP18Q9UMW8 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC5.36□□□□□ -1.55
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