Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 AC013404.1-201ENST00000413068 249 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 TPT1P2-201ENST00000413105 503 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 ARL2BPP3-201ENST00000421226 480 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 AC234781.1-201ENST00000444722 459 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 RPS29P31-201ENST00000446147 164 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 AC007688.1-201ENST00000475592 759 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 LINC02027-201ENST00000482617 596 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 AC093663.2-201ENST00000484625 313 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 AL132838.2-201ENST00000492041 314 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 AC024022.1-202ENST00000508911 394 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 LINC02480-201ENST00000511875 612 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 SETP12-201ENST00000514068 805 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 TATDN1-202ENST00000517678 815 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 NSMCE2-206ENST00000519010 848 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 AC113423.1-201ENST00000523279 289 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 AP006287.2-201ENST00000529036 502 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 AC004923.2-201ENST00000529649 369 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 PARPBP-212ENST00000543784 992 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 AL137129.1-201ENST00000555937 720 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 CHEK2P2-203ENST00000566448 670 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 MIR548Y-201ENST00000582739 110 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 AP005120.1-202ENST00000584321 506 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 TTN-AS1-228ENST00000589234 751 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 AL157392.3-211ENST00000599378 509 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 AC135178.6-201ENST00000605314 398 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 AL662844.3-201ENST00000606909 517 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 LINC00649-214ENST00000609132 668 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 BPY2B-204ENST00000615850 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 AC139769.3-201ENST00000618383 175 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 BPY2C-204ENST00000618574 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 LINC02456-201ENST00000635615 1323 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 CEP170-202ENST00000366542 6828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 MS4A1-212ENST00000534668 3475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 C4orf47-201ENST00000378850 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 ZNF788-202ENST00000397759 777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 RNA5SP498-201ENST00000411342 120 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 OR5BE1P-201ENST00000425977 939 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 MRPL50P1-201ENST00000431951 384 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 BMS1P19-201ENST00000433925 393 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 AL080313.1-201ENST00000434947 405 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 OR4C10P-201ENST00000434991 931 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 MTND4P15-201ENST00000437913 1033 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 AC024084.1-201ENST00000440744 455 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 AC005871.1-201ENST00000450247 475 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 HMGB1P26-201ENST00000452520 628 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 DCUN1D1-204ENST00000469954 970 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 AC108729.2-201ENST00000476543 840 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 SLC25A15P5-201ENST00000508033 253 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 COL6A4P2-205ENST00000509855 506 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 OR5M1-201ENST00000526538 948 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 KBTBD3-204ENST00000531482 874 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 CYP2C60P-201ENST00000566088 139 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 AC010528.1-201ENST00000568714 739 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 AC005695.2-201ENST00000579641 259 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 AC022916.3-201ENST00000592961 742 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 BNIP3P33-201ENST00000598912 569 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 AC008946.1-201ENST00000599756 421 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 AC011472.4-201ENST00000615848 491 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 AC245389.2-201ENST00000616023 576 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
NRF1Q16656 AC242843.1-201ENST00000618702 573 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms