Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 RN7SKP141-201ENST00000516167 338 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 KCTD9P6-201ENST00000522306 950 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 AL354920.1-202ENST00000531661 1017 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 AC068768.1-204ENST00000544890 796 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 AC009558.2-201ENST00000558258 396 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 RAG2-201ENST00000311485 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 AC004852.2-204ENST00000614137 1370 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 MIER3-203ENST00000381213 5198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 MTND4P22-201ENST00000413116 1169 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 NDUFB4P5-201ENST00000415445 361 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 AL354956.1-201ENST00000424487 467 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 AP000907.1-201ENST00000428428 510 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 FAIM-205ENST00000464668 641 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 AC093267.1-201ENST00000489176 961 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 AC073530.1-201ENST00000535917 775 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 EGLN3-AS1-201ENST00000555922 308 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 AC090125.1-201ENST00000581541 493 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 AC093330.1-201ENST00000583326 568 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 AC090912.3-201ENST00000609775 533 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 LINC02335-201ENST00000616578 659 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 THRA1/BTR-204ENST00000621191 513 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 ATP2B1-201ENST00000261173 6777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 OR6Y1-202ENST00000641282 3702 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 AL136964.1-201ENST00000622038 2990 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 AL592437.2-201ENST00000421655 2434 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 KIAA1841-202ENST00000356719 2149 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.93
HMGN3Q15651 CEP44-201ENST00000296519 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 DICER1-203ENST00000526495 10331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 MIR148B-201ENST00000362252 99 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 RNU6-729P-201ENST00000384399 107 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 AL136131.1-201ENST00000406079 803 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 RANP4-201ENST00000413361 655 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 TCEA1P4-201ENST00000415066 844 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 SDCBPP3-201ENST00000419629 891 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 AL034379.1-201ENST00000423216 253 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 AL353613.1-201ENST00000443163 530 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 H2AFZP6-201ENST00000444403 394 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 RPL23AP12-201ENST00000467573 473 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 RN7SL594P-201ENST00000470590 287 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 AC023598.1-201ENST00000472521 361 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 FTH1P24-201ENST00000503502 462 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 NRG1-IT3-201ENST00000519023 505 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 IGKV2D-19-201ENST00000523346 262 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 AP002993.1-201ENST00000538624 210 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 AC026333.2-201ENST00000542164 106 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 DUXAP6-201ENST00000553858 601 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 AL592494.2-201ENST00000425455 1548 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 KIF15-203ENST00000425755 3460 ntTSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 AC008505.1-203ENST00000637345 1766 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 AK3-201ENST00000359883 1536 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 STXBP4-203ENST00000405898 2229 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
HMGN3Q15651 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 134.7 ms