Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC4.62□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 TAX1BP1-202ENST00000396319 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 OR2L13-202ENST00000641714 1948 ntAPPRIS P1 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC4.62□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AL161911.1-202ENST00000464488 1534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.62□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 LRRTM4-203ENST00000409282 2451 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 ZC2HC1B-201ENST00000237275 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 TMSB4XP4-201ENST00000323496 618 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 RNU6-1066P-201ENST00000363573 105 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 OR5H15-201ENST00000383696 930 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 TAS2R31-201ENST00000390675 1021 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 RNU6-1300P-201ENST00000391046 108 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AL049610.1-201ENST00000423374 372 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AL122034.1-201ENST00000427609 497 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC104843.2-201ENST00000427666 297 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC007559.1-201ENST00000428736 355 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 NPM1P34-201ENST00000428821 893 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AL445259.1-202ENST00000434768 379 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC026167.1-201ENST00000435651 299 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 MTND4P6-201ENST00000438297 472 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AL929236.1-201ENST00000443622 518 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AL731568.1-201ENST00000445111 434 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC006042.4-201ENST00000451066 692 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 CLEC2A-202ENST00000455827 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 LINC01921-201ENST00000456163 393 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC011287.2-201ENST00000456809 842 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 SETP20-201ENST00000457046 852 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AP000893.1-201ENST00000474462 794 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC090686.1-201ENST00000481577 749 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 NCOR1P1-202ENST00000486162 291 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
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SEC23BQ15437 LTV1P1-201ENST00000510683 1237 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 GTF2F2P1-201ENST00000511083 675 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC112178.1-201ENST00000511165 676 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 TET2-AS1-201ENST00000515414 537 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 RN7SKP46-201ENST00000515942 234 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC009652.2-201ENST00000527978 516 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC073912.2-201ENST00000542821 317 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 RPLP0-225ENST00000552292 720 ntTSL 2 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 DNAL1-206ENST00000554871 632 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC022404.1-201ENST00000555320 273 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
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SEC23BQ15437 KLRC1-201ENST00000347831 1332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
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SEC23BQ15437 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 DCN-201ENST00000052754 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 DHX9P1-201ENST00000436565 3076 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 OR52B1P-201ENST00000316506 909 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 OR4F6-201ENST00000328882 1238 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 MIR600-201ENST00000385007 98 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 SNORA17A-201ENST00000391185 133 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 KRTAP3-2-201ENST00000391587 702 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 SNORA77-201ENST00000408716 125 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 RPL31-204ENST00000409038 817 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC004987.3-201ENST00000413879 771 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 FCF1P2-201ENST00000415284 583 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AL020993.1-201ENST00000420172 297 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AC093655.2-201ENST00000425735 631 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AL590399.3-201ENST00000438072 543 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AL162419.1-201ENST00000440674 873 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 LINC01704-202ENST00000442358 649 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
SEC23BQ15437 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
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