Protein–RNA interactions for Protein: Q13326

SGCG, Gamma-sarcoglycan, humanhuman

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Length 291 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCGQ13326 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 RN7SKP234-201ENST00000517173 224 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC018861.2-201ENST00000518078 513 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC087242.1-201ENST00000536931 572 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC009509.2-201ENST00000538640 429 ntTSL 2 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 TRDN-204ENST00000542443 1294 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC009803.3-201ENST00000548457 540 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC051619.4-201ENST00000560034 292 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 RPL23AP97-201ENST00000568955 471 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AGGF1P6-201ENST00000569213 976 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC126365.2-201ENST00000580630 379 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 DSCR9-205ENST00000585273 751 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC011524.1-201ENST00000590167 240 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC079610.2-201ENST00000604818 690 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 MIR548A1HG-201ENST00000636739 558 ntTSL 4 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC4.25□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 DAOA-211ENST00000618629 1368 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 LRMP-201ENST00000354454 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.25□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 OR5H14-202ENST00000641380 7323 ntAPPRIS P1 BASIC4.25□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 EEF1A1P42-201ENST00000613436 1331 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 TFPI-203ENST00000392365 3649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 TSHB-201ENST00000256592 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 TFPI-202ENST00000339091 1088 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 RNA5SP27-201ENST00000363839 119 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 SNORA70E-201ENST00000384492 135 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 HMGB3P19-201ENST00000403971 560 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 RN7SKP199-201ENST00000410325 305 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 CEACAMP8-201ENST00000413902 580 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 LINC01752-201ENST00000417299 438 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 RPEP2-201ENST00000432149 701 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC002465.1-201ENST00000436097 349 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 CNOT10-AS1-201ENST00000475395 466 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC090013.1-201ENST00000485147 480 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 CAPZA2-212ENST00000490693 809 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 SUMO2P5-201ENST00000506790 245 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC104827.1-202ENST00000511917 1049 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC023141.12-201ENST00000512399 199 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC025917.1-201ENST00000562062 612 ntTSL 3 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 GOLGA8M-203ENST00000568033 557 ntTSL 4 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AP000919.1-202ENST00000581139 1264 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AL669942.2-201ENST00000620352 697 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AP003476.1-201ENST00000623984 516 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 ASAH1-263ENST00000637872 886 ntTSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 NUP35-201ENST00000295119 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 PIGW-206ENST00000620233 2264 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 Z82217.1-201ENST00000625157 8149 ntBASIC4.24□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.24□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 LUM-201ENST00000266718 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC4.24□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 ETV1-203ENST00000403527 3363 ntTSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AGTR1-202ENST00000402260 2172 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AJ009632.2-204ENST00000635621 1401 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 AP002784.2-201ENST00000397300 549 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
SGCGQ13326 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC4.23□□□□□ -1.73
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