Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 SLC17A1-204ENST00000476801 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 CFHR3-206ENST00000617219 1462 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 PHEX-201ENST00000379374 6172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 VEZT-201ENST00000261219 3435 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 RPL9-201ENST00000295955 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 CAPZA3-201ENST00000317658 1087 ntAPPRIS P1 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 AL590806.1-201ENST00000415818 853 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 MAP1LC3BP1-201ENST00000417653 379 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 RPEP2-201ENST00000432149 701 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 DOCK9-AS1-201ENST00000439367 392 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 AC004263.1-201ENST00000479327 332 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 ATP5J2-209ENST00000488775 306 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 AC108043.1-201ENST00000512696 574 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 AC105233.3-201ENST00000531125 744 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 AC025884.1-201ENST00000556034 378 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 AC138207.6-203ENST00000581652 565 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 AL161896.1-201ENST00000597248 508 ntTSL 4 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 AC008638.3-201ENST00000603341 463 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 LINC01440-205ENST00000608080 737 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 LINC02340-201ENST00000610335 626 ntTSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 MALAT1-205ENST00000610851 584 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 AL445363.3-201ENST00000623080 671 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 ATL2-217ENST00000629272 1242 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 C2orf16-202ENST00000447166 16401 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 C1orf141-208ENST00000621590 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 MTTP-201ENST00000265517 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 WDR72-204ENST00000559418 3602 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 ZNF849P-201ENST00000594711 1566 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 AC092162.3-201ENST00000624511 1624 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 IFI16-208ENST00000448393 2245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 OR5AC2-201ENST00000358642 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 PMS1-202ENST00000374826 948 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 TEX30-204ENST00000376027 1106 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 SNORD66.1-201ENST00000391230 76 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 RPL31-206ENST00000409650 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 AC092484.1-201ENST00000420548 833 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
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TRAF1Q13077 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
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TRAF1Q13077 NDUFS5P3-201ENST00000450668 321 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 RBBP6-204ENST00000452655 854 ntTSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 CCNB1IP1P3-201ENST00000454702 829 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 NAP1L1P3-201ENST00000462291 880 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 RPS7P7-201ENST00000463499 571 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 AP000563.1-201ENST00000490865 758 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 AL078612.2-201ENST00000525133 646 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 AL163973.2-201ENST00000548096 288 ntTSL 3 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 PSMA3-213ENST00000557508 814 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 AMZ2-204ENST00000577273 895 ntTSL 5 BASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 AC067838.1-201ENST00000606064 577 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
TRAF1Q13077 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC4.87□□□□□ -1.63
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