Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 AC005858.1-201ENST00000620193 677 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 ZNF525-202ENST00000474037 3890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 IRF5P1-201ENST00000504852 2164 ntBASIC5.13□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 LINC02240-201ENST00000564199 1336 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 SULT1E1-201ENST00000226444 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 USP8-204ENST00000425032 3559 ntTSL 2 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 EIF3M-208ENST00000531120 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 UACA-211ENST00000560441 4723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 MAMDC2-AS1-201ENST00000377178 1504 ntTSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 GTF2H1-204ENST00000524753 1510 ntTSL 3 BASIC5.13□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 ZNF562-201ENST00000293648 12380 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 ACADSB-201ENST00000358776 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 ZNF704-201ENST00000327835 14386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 TENM1-202ENST00000422452 12891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 AC119744.1-201ENST00000454746 1715 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 AL603750.1-201ENST00000624216 1717 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 IFIT1-201ENST00000371804 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 OR2D2-201ENST00000299459 1110 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 ELSPBP1-201ENST00000339841 1052 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 DPPA3-201ENST00000345088 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 AC009480.2-201ENST00000422916 432 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 RPL7P4-203ENST00000430239 730 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 AC092013.1-201ENST00000438795 332 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 AL353572.1-201ENST00000442490 417 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 AL161912.1-201ENST00000448475 524 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 AC079776.3-201ENST00000450665 370 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 TMSB4X-204ENST00000451311 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 AC068707.1-201ENST00000451438 391 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 AC010894.4-201ENST00000454203 457 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 AL445488.1-201ENST00000457272 706 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 GRM7-AS3-209ENST00000458713 454 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 RN7SL319P-201ENST00000480656 221 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 BTBD11-206ENST00000494235 811 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 EEF1A1P25-201ENST00000495704 1267 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 AC140172.1-201ENST00000502928 141 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 LINC02118-201ENST00000505899 407 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 MRPS33P2-201ENST00000507850 322 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 ENPP7P9-201ENST00000514456 627 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 LINC02201-203ENST00000514657 674 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 Y_RNA.719-201ENST00000517156 106 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 TAS2R43-201ENST00000531678 1027 ntAPPRIS P1 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 AP006289.1-201ENST00000538089 277 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 LINC02375-201ENST00000545739 852 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 LINC02444-201ENST00000550723 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 AL392023.2-202ENST00000555342 494 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 AC002091.1-201ENST00000578788 557 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 LINC01470-205ENST00000584829 681 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 GALNT1-205ENST00000591081 1120 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 AC092364.1-202ENST00000593824 565 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 ANKRD36C-207ENST00000612359 650 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 AC008083.4-201ENST00000615076 444 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 AC022031.1-201ENST00000585985 2593 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 ZNF765-201ENST00000396408 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 EMSY-205ENST00000524767 4116 ntTSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 MYCT1-201ENST00000367245 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC5.12□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 ZEB1-208ENST00000542815 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 ADAMTS9-AS1-203ENST00000471990 1606 ntTSL 2 BASIC5.12□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.12□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 ASXL3-201ENST00000269197 11399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 C5-201ENST00000223642 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 RBMS1-202ENST00000392753 3781 ntTSL 5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 OR1A1-203ENST00000641732 3832 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 MFSD8-216ENST00000641147 4009 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 AP001284.1-201ENST00000528393 2118 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 LINC01619-203ENST00000549802 2169 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 OR4E1-202ENST00000641792 3742 ntAPPRIS P5 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 RN7SKP95-201ENST00000362860 303 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.11□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 SNORA51.12-201ENST00000384448 134 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 AC019064.1-201ENST00000414796 499 ntTSL 2 BASIC5.11□□□□□ -1.59
SCAPQ12770 RPL6P29-201ENST00000414863 865 ntBASIC5.11□□□□□ -1.59
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