Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TTPAP49638 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TTPAP49638 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TTPAP49638 AP001267.3-202ENST00000525992 448 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TTPAP49638 AC013549.2-201ENST00000526953 489 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TTPAP49638 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TTPAP49638 AC009558.2-201ENST00000558258 396 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TTPAP49638 DISC1FP1-202ENST00000562245 774 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TTPAP49638 AC011468.1-201ENST00000569091 675 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
TTPAP49638 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TTPAP49638 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TTPAP49638 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TTPAP49638 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TTPAP49638 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TTPAP49638 AL391497.1-201ENST00000608671 547 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TTPAP49638 AC006946.3-201ENST00000609791 756 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TTPAP49638 AL713922.2-201ENST00000619384 716 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
TTPAP49638 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TTPAP49638 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TTPAP49638 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
TTPAP49638 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TTPAP49638 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
TTPAP49638 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
TTPAP49638 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
TTPAP49638 LINC01247-201ENST00000448901 4209 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
TTPAP49638 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
TTPAP49638 ATXN3-248ENST00000558190 26812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
TTPAP49638 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
TTPAP49638 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
TTPAP49638 UBE2D2-201ENST00000253815 444 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TTPAP49638 CDKL4-202ENST00000395035 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
TTPAP49638 RPL7P60-201ENST00000397636 735 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TTPAP49638 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TTPAP49638 FAM230B-202ENST00000415704 396 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TTPAP49638 LINC01074-201ENST00000422527 555 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TTPAP49638 NIPA2P1-201ENST00000426223 976 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TTPAP49638 ISM1-AS1-201ENST00000431407 652 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
TTPAP49638 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
TTPAP49638 AC011037.1-201ENST00000483964 558 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
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TTPAP49638 AC034223.2-201ENST00000511840 425 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TTPAP49638 LINC02365-202ENST00000520280 607 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
TTPAP49638 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
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TTPAP49638 RNASE6-201ENST00000304677 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
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TTPAP49638 AL158212.2-201ENST00000369391 460 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TTPAP49638 CGA-201ENST00000369582 729 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
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TTPAP49638 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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TTPAP49638 AC135457.1-201ENST00000503553 664 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
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TTPAP49638 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TTPAP49638 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TTPAP49638 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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TTPAP49638 AC136475.4-201ENST00000534271 280 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
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TTPAP49638 AL049844.2-201ENST00000604280 628 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TTPAP49638 AL096803.3-201ENST00000609032 532 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
TTPAP49638 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TTPAP49638 FTO-223ENST00000640179 210 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
TTPAP49638 TNFAIP6-201ENST00000243347 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
TTPAP49638 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
TTPAP49638 SCEL-202ENST00000377246 3081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
TTPAP49638 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
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