Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.09□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC5.09□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 CHL1-216ENST00000620033 7311 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 RASA1-202ENST00000456692 3776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 GYPA-211ENST00000535709 695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 AC026888.1-201ENST00000553348 559 ntTSL 4 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 AC092142.2-201ENST00000614642 354 ntTSL 3 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 SATB1-AS1-263ENST00000630022 622 ntTSL 5 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 AC125336.1-201ENST00000508893 2827 ntBASIC5.08□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 SLC30A7-201ENST00000357650 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 AC096554.1-201ENST00000458182 529 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 MFAP3L-206ENST00000506110 548 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 AC079209.2-201ENST00000519107 431 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 NRBF2P5-201ENST00000603087 788 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 UGT2B4-207ENST00000639621 1154 ntTSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 AC007656.2-201ENST00000624902 4547 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 THAP12P8-201ENST00000447914 2115 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 CEP170P1-201ENST00000502249 4587 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 ATP13A3-211ENST00000619199 5227 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 AC092435.3-201ENST00000565538 3654 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 OR5J1P-201ENST00000313544 939 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 HMGB3P20-201ENST00000417997 600 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 AC096638.2-201ENST00000434965 711 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 RPL12P18-201ENST00000437175 325 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 GABRG3-AS1-201ENST00000439938 970 ntTSL 2 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 AL161725.2-201ENST00000442442 403 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 AC104653.1-202ENST00000446401 390 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 AC093722.1-201ENST00000504882 489 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 AC034223.2-201ENST00000511840 425 ntTSL 3 BASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 MIR4435-1-201ENST00000582552 80 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 VN1R78P-201ENST00000597393 564 ntBASIC5.07□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 ATP7A-202ENST00000343533 8289 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 HSPA8P19-201ENST00000505359 1517 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 BTG4-203ENST00000525791 1394 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 AL117337.1-201ENST00000412789 444 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 NAP1L1P2-201ENST00000414182 1089 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 AL589946.1-201ENST00000421465 420 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 OR5AW1P-201ENST00000426334 1006 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 AC018442.3-201ENST00000523025 183 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 AL049840.6-202ENST00000603373 279 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 AC006363.1-201ENST00000603806 463 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC5.06□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 AP000542.2-201ENST00000623199 6179 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 SLC38A9-201ENST00000318672 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 GSTA1-201ENST00000334575 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 OR5K4-201ENST00000354924 966 ntAPPRIS P1 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 SRIP2-201ENST00000428470 166 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 AC021678.1-201ENST00000505195 936 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 MIR7515HG-239ENST00000591053 1113 ntTSL 5 BASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 RNVU1-4-201ENST00000612985 164 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 AC139713.2-210ENST00000641741 992 ntBASIC5.05□□□□□ -1.6
PTPRMP28827 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC5.05□□□□□ -1.6
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