Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2H5

USP35, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 35, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP35Q9P2H5 CYCSP28-201ENST00000534284 321 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AC087465.1-201ENST00000560574 245 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AC066612.1-202ENST00000561094 518 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AC090371.2-203ENST00000578782 473 ntTSL 3 BASIC6.58□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 LINC01676-204ENST00000595309 871 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 SOX2-OT-224ENST00000595313 716 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 LINC01930-201ENST00000602672 870 ntTSL 5 BASIC6.58□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 FP236315.3-201ENST00000623587 307 ntTSL 2 BASIC6.58□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 FAM157B-203ENST00000639350 358 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 RNF182-207ENST00000537663 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC6.58□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 ZNF28-204ENST00000457749 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 SDHC-202ENST00000367975 13566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.58□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 OR6C2-202ENST00000641202 2105 ntAPPRIS P1 BASIC6.58□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC6.58□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 PARP15-206ENST00000493645 1311 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 CLVS1-201ENST00000325897 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 PLEKHG7-201ENST00000344636 3868 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 SNORA37-201ENST00000384504 129 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 MIR129-1-201ENST00000384972 72 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 LINC01341-201ENST00000419361 552 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 Z97206.2-201ENST00000423489 589 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AC116035.1-201ENST00000431057 517 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AC241644.1-201ENST00000431525 446 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AL445644.1-201ENST00000436524 751 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AC013460.1-205ENST00000450695 518 ntTSL 4 BASIC6.57□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AL133477.1-201ENST00000457472 514 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 GUCA1C-203ENST00000471108 633 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AC073358.1-201ENST00000505671 684 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AC079395.1-201ENST00000510981 262 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AC099550.1-201ENST00000515495 871 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 RNA5SP392-201ENST00000516905 112 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 MTND2P26-201ENST00000528255 1029 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 C15orf41-205ENST00000563167 772 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 GRID2-208ENST00000611049 4844 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 DNAH14-208ENST00000430092 13763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 PDE4D-205ENST00000360047 3122 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 ADGRL2-204ENST00000370715 5585 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 ATP2C1-205ENST00000504381 3498 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 NKIRAS1-209ENST00000614374 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC6.57□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 ABI3BP-215ENST00000495063 3714 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 FAM216B-201ENST00000313851 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 HEATR5A-203ENST00000543095 7840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AC011900.1-201ENST00000446838 2999 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 MYBPC1-205ENST00000536007 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 MYBPC1-206ENST00000541119 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 OR4A15-201ENST00000314706 1035 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 IGKV1OR9-1-201ENST00000424370 284 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AC008065.1-201ENST00000428525 348 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AP000146.1-202ENST00000441666 441 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AL359715.2-201ENST00000452402 682 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 COX7A2-205ENST00000460985 357 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AC109327.1-201ENST00000471666 403 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 RPS24P16-201ENST00000497294 392 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AC091951.3-201ENST00000504093 246 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AC009803.2-201ENST00000550378 665 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AC009142.1-202ENST00000562565 563 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 OR4K7P-201ENST00000580232 945 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 MIR3939-201ENST00000582614 106 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC6.56□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AL355493.4-201ENST00000618530 292 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 MIR4278-201ENST00000636094 69 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
USP35Q9P2H5 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
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