Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AL024474.1-201ENST00000404655 591 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AL391704.1-203ENST00000414903 462 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AC079163.1-201ENST00000418416 407 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 RPS15AP30-201ENST00000420976 390 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AL157834.1-201ENST00000422744 420 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 PRH1-201ENST00000428168 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AC073257.1-201ENST00000432474 523 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AL049594.1-201ENST00000432834 805 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 LINC02094-201ENST00000437646 520 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 POU5F1P5-201ENST00000445059 658 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 FGF7P3-201ENST00000454645 303 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AL031275.1-201ENST00000457405 418 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 GM2AP2-201ENST00000491764 562 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 OR4D12P-201ENST00000509361 911 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 BTF3P13-201ENST00000513224 490 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 RNU4-29P-201ENST00000515943 174 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 LINC01033-204ENST00000523194 715 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 CYCSP25-201ENST00000525280 316 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AP002815.1-201ENST00000533740 386 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AP001858.2-201ENST00000536213 601 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 HNF1A-AS1-203ENST00000537361 659 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AC007569.1-202ENST00000547282 303 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AC068831.4-201ENST00000556118 109 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 NCAPGP2-201ENST00000557911 754 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AC004943.1-202ENST00000558618 503 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 MIR4732-201ENST00000581873 76 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 Z98949.1-204ENST00000595102 731 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AC021646.1-201ENST00000605469 484 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AL390877.1-201ENST00000605704 214 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 OR1N2-202ENST00000616791 993 ntAPPRIS P2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AC092683.2-203ENST00000618807 788 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 ATP5A1P4-201ENST00000556888 1605 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 GPBP1-201ENST00000264779 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 PIGA-216ENST00000637296 2113 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 PKN2-202ENST00000370513 2890 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 TMC5-201ENST00000219821 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 SATB1-209ENST00000454909 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 TTC41P-205ENST00000551270 3963 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 RAPGEF4-203ENST00000397087 4120 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 SPATA31D5P-202ENST00000527857 4863 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 GABRA2-215ENST00000540012 2588 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 CCDC150-202ENST00000409270 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AP001267.1-201ENST00000531742 2074 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 PSG1-206ENST00000595356 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 TTC37-201ENST00000358746 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 LRRC36-202ENST00000435835 1765 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 LINC02183-201ENST00000637822 1732 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 FAM114A2-201ENST00000351797 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 LINC00891-201ENST00000627173 4113 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 DYDC1-202ENST00000372204 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 RN7SKP235-201ENST00000410662 305 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 BEND7P1-201ENST00000422058 457 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 LINC01435-201ENST00000425050 722 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 LYPLA1P1-201ENST00000434514 622 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 PPIAP10-201ENST00000438675 458 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AL138799.3-201ENST00000438968 350 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 SPRYD7P1-201ENST00000443861 570 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 GAPDHP23-201ENST00000444823 993 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 SIDT1-AS1-201ENST00000462180 465 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AL117692.1-201ENST00000494283 713 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AC114797.1-201ENST00000514003 728 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AC009597.1-201ENST00000521215 584 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AP003100.1-201ENST00000524772 832 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AC091132.1-201ENST00000588189 547 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AC002128.2-201ENST00000604161 618 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AC106900.2-201ENST00000604994 317 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AC004921.1-201ENST00000608884 733 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AL137067.2-201ENST00000621202 131 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 AC211486.4-201ENST00000621495 113 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 TEX41-293ENST00000630451 690 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
BHLHE41Q9C0J9 FOCAD-202ENST00000380249 6096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.7 ms