Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW5

TM6SF1, Transmembrane 6 superfamily member 1, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM6SF1Q9BZW5 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 AC000123.3-201ENST00000624029 4975 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 AKAP4-201ENST00000358526 2881 ntTSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 EXO1-208ENST00000518483 2899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.77□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 HSPA8P17-201ENST00000427029 1382 ntBASIC4.77□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 LGI1-228ENST00000637689 1802 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 FOXP2-205ENST00000393489 2285 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 AC008432.1-201ENST00000615912 1320 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 LINC01189-201ENST00000428440 3321 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 ZNF573-217ENST00000590414 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 RNU11-4P-201ENST00000391149 133 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 ATF1P1-201ENST00000406040 927 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 BBIP1-203ENST00000423273 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 AC239803.1-202ENST00000432038 590 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 AC096638.2-201ENST00000434965 711 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 GSTA9P-202ENST00000448991 521 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 FAM104B-204ENST00000472571 1109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 AC025566.1-201ENST00000477153 490 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 AC092691.3-201ENST00000482766 510 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 C1orf143-202ENST00000491260 813 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 RFESD-208ENST00000513950 464 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 AC078906.1-201ENST00000523602 798 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 EMP1-206ENST00000537612 505 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 OSBPL9P5-201ENST00000542581 171 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 CR383656.6-201ENST00000550518 394 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 AC026888.1-201ENST00000553348 559 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 AL355095.1-201ENST00000554451 539 ntTSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 AC012379.1-201ENST00000558304 406 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 AC018552.1-201ENST00000562099 811 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 AC092140.1-201ENST00000563090 549 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 C1QBP-206ENST00000574444 901 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 AC007448.1-201ENST00000582714 234 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 IPO5P1-202ENST00000600039 287 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 AC012557.1-201ENST00000607115 611 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 VN1R9P-201ENST00000614184 867 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 AC124312.6-202ENST00000623624 418 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 AC135584.1-201ENST00000624438 333 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 MIR7641-1-201ENST00000627518 61 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 LINC01709-202ENST00000635702 1204 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 OR11H4-203ENST00000641525 1082 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 APC-207ENST00000508376 10619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 LINC01192-202ENST00000470546 1519 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 MTND4P26-201ENST00000415971 1359 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 AC005261.4-201ENST00000600047 1385 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 AC005332.5-201ENST00000591222 2919 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 PNPLA8-204ENST00000426128 4268 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 UBA6-201ENST00000322244 9564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 SGO1-205ENST00000419233 1582 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 MAP3K21-201ENST00000366622 4005 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 EED-206ENST00000527888 1422 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 BPY2-202ENST00000382585 321 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 LIPT1P1-201ENST00000415870 1186 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 USP9YP24-201ENST00000434374 697 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 CR769776.1-201ENST00000441254 787 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 YWHAQP9-201ENST00000445891 512 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 AL035409.1-201ENST00000454305 497 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 RPS27L-205ENST00000462430 681 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 AC091180.4-201ENST00000511322 245 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 AC008415.1-201ENST00000522189 734 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 AC090607.1-201ENST00000560057 449 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 AC010735.1-201ENST00000567305 1026 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 AC018558.3-201ENST00000567902 572 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TM6SF1Q9BZW5 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.6 ms