Protein–RNA interactions for Protein: Q96LD1

SGCZ, Zeta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCZQ96LD1 AC011477.1-204ENST00000623416 1325 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 AC025031.4-201ENST00000621248 3271 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 LDHAL6CP-202ENST00000550738 3224 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 EAF2-201ENST00000273668 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 SNURFL-201ENST00000309296 343 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 NAP1L4P1-201ENST00000319092 1157 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 DEC1-201ENST00000374016 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 RNU6-339P-201ENST00000384310 107 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 AL078599.1-201ENST00000402075 293 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 PIGPP2-201ENST00000411569 458 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 AC016769.2-201ENST00000414815 475 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 AMMECR1LP1-201ENST00000415152 841 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 P2RY10P2-201ENST00000416730 913 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 TRBV29-1-201ENST00000422143 402 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 TMEM196-203ENST00000422233 775 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 AC093698.1-201ENST00000423843 571 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 AL354863.1-204ENST00000436430 556 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 UBE2D3P1-201ENST00000436669 444 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 AC127537.2-201ENST00000439258 465 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 AC092647.3-201ENST00000443044 633 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 AL137845.2-201ENST00000444292 988 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 DIAPH2-AS1-202ENST00000445414 606 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 AC009158.1-205ENST00000452511 895 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 AC092647.2-201ENST00000452998 253 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 RPL7P1-201ENST00000468161 747 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 RPL7P9-201ENST00000468715 747 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 AC023424.1-201ENST00000496058 459 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 UBE2Q2P10-201ENST00000514854 900 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 RNU4ATAC18P-201ENST00000516179 126 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 AC106028.2-201ENST00000555325 464 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 AC020659.1-204ENST00000562920 400 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 AC135050.5-201ENST00000576336 543 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 AC022154.1-203ENST00000594850 493 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 Z98949.1-211ENST00000596813 773 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 AC010618.3-202ENST00000598141 476 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 AC011626.1-201ENST00000604710 562 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 SOX2OT_exon1.1-201ENST00000614902 232 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 MIR6730-201ENST00000622213 67 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 AC010608.2-201ENST00000624830 470 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 PCBP1-AS1-278ENST00000625518 864 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 PCBP1-AS1-307ENST00000627050 912 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 PRUNE2-204ENST00000376718 12584 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 GABRG1-201ENST00000295452 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 CDKL3-209ENST00000523054 1775 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 C5orf42-201ENST00000425232 11199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 OR1A1-202ENST00000641322 3743 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 PTK2-206ENST00000517712 3351 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 PMCHL2-201ENST00000415808 1841 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 KLHL4-202ENST00000373119 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 IL31RA-204ENST00000396834 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 HHLA2-210ENST00000491820 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 CTAGE5-210ENST00000553728 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 RPL23AP57-201ENST00000332361 466 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 RN7SKP113-201ENST00000363891 295 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 RNU4-4P-201ENST00000364588 130 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 SNORD116-8-201ENST00000384365 95 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 RNA5SP241-201ENST00000391326 114 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 ADAM24P-201ENST00000398655 2101 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 RNU6ATAC7P-201ENST00000408111 127 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 GLRXP1-201ENST00000423261 334 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 AC018832.1-201ENST00000428171 566 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 ZYG11AP1-201ENST00000430329 837 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
SGCZQ96LD1 RPL36AP15-201ENST00000444514 266 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.5 ms