Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 CSN1S1-203ENST00000507763 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AC097103.2-204ENST00000510068 569 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 KRT19P6-201ENST00000510983 209 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AC099522.1-202ENST00000514718 367 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 LINC02353-201ENST00000515181 849 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 PRELID3BP4-201ENST00000515476 571 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 LINC02290-201ENST00000554187 608 ntTSL 4 BASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 PSMB7P1-201ENST00000556349 514 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AC087286.1-201ENST00000560712 568 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 APOOP5-203ENST00000565921 410 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AC079171.1-201ENST00000568788 914 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AC007993.3-202ENST00000585329 725 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 EIF1P6-201ENST00000600054 334 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 Z82195.1-201ENST00000604558 398 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AC114878.2-201ENST00000604863 1251 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AC243654.2-201ENST00000612843 443 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AL023881.1-201ENST00000621088 301 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
GTF3C6Q969F1 TAB3-204ENST00000378932 3698 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 TENM1-201ENST00000371130 12875 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 RNU1-32P-201ENST00000363937 159 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 RNA5SP366-201ENST00000365454 123 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 KRTAP19-8-201ENST00000382822 318 ntAPPRIS P1 BASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 TEX41-203ENST00000420472 765 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 LINC00266-4P-201ENST00000427373 842 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 AC114973.1-201ENST00000429057 632 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 AC009263.1-201ENST00000441193 1239 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 AC099063.2-201ENST00000446360 662 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 AL121877.1-201ENST00000453704 622 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 LINC01878-202ENST00000453965 405 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 CDKN3-205ENST00000458126 845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 RN7SL303P-201ENST00000469773 251 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 RPL23AP2-201ENST00000471227 466 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 AC010285.3-201ENST00000511668 676 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 AP001207.2-201ENST00000519490 539 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 OR8I1P-201ENST00000529291 931 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 PDCD5P1-201ENST00000543528 309 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 PRH1-206ENST00000543626 710 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 AC063947.1-201ENST00000549036 557 ntTSL 4 BASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 TVP23BP1-201ENST00000557500 617 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 AC007496.1-201ENST00000565641 739 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 MIR4509-3-201ENST00000578671 94 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 MIR4509-2-201ENST00000583920 94 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 VN1R84P-201ENST00000593697 235 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 AC010200.2-201ENST00000605098 235 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 AC034229.4-201ENST00000607861 441 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 AC026368.1-201ENST00000614934 690 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 MIR4509-1-201ENST00000618224 94 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 AC013727.1-201ENST00000618581 839 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 AL356121.2-201ENST00000624715 780 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 AC244517.5-203ENST00000624778 517 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 AP000843.1-201ENST00000624880 701 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 ADGRG2-205ENST00000357991 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 PRLR-217ENST00000618457 11688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 MTRNR2L6-201ENST00000604952 1447 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 EMCN-209ENST00000511970 1377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 SPATA31D2P-201ENST00000429999 4388 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 SYF2-202ENST00000354361 926 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 MIR92A2-201ENST00000385299 75 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 ZNF602P-201ENST00000405929 924 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 RAB28P1-201ENST00000411517 641 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 IQCA1-AS1-201ENST00000413353 489 ntTSL 3 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 AC099336.2-201ENST00000422457 254 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 ARPP21-211ENST00000427542 568 ntTSL 4 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 MTCO1P54-201ENST00000430139 712 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 COX6B1P7-201ENST00000430845 235 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 LINC01745-201ENST00000430921 372 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 LINC00280-201ENST00000439525 448 ntTSL 2 BASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
GTF3C6Q969F1 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms