Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 PLS3-203ENST00000420625 3150 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 MLF1-208ENST00000478894 1372 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 ZC3H14-206ENST00000406216 1341 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 AL353746.1-201ENST00000566293 6881 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 UQCR10-201ENST00000330029 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 CRP-203ENST00000368111 512 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 OR2B3-201ENST00000377173 1106 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 SIRPD-201ENST00000381621 823 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 MIR184-201ENST00000384962 84 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 MIR141-201ENST00000384975 95 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 AC007349.1-201ENST00000419326 587 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 PTP4A1P5-201ENST00000420305 455 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 AL159169.1-201ENST00000421119 127 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 OSTCP5-201ENST00000425293 453 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 AC017083.1-201ENST00000428093 483 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 AC234781.1-201ENST00000444722 459 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 AC099794.1-201ENST00000450811 447 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 AC009220.1-201ENST00000451614 275 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 TVP23BP2-201ENST00000455082 615 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 LARP7P4-201ENST00000481075 878 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 LINC02000-201ENST00000483245 640 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 CEACAMP10-202ENST00000495431 496 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 SNX5P1-201ENST00000505757 1041 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 TMPRSS11BNL-205ENST00000514295 1262 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 EQTN-204ENST00000537675 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 SNHG1-205ENST00000537869 1038 ntTSL 3 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 AC053481.4-201ENST00000583164 216 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 AP001542.3-201ENST00000587619 527 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 CT45A9-201ENST00000604569 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 AC103710.3-201ENST00000608157 948 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 CT45A10-202ENST00000617981 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 FP236240.3-201ENST00000623061 327 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 OR5T1-201ENST00000641368 1118 ntAPPRIS P1 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 TNNI3K-201ENST00000326637 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 CYP3A4-201ENST00000336411 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 ZNF479-201ENST00000319636 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.98□□□□□ -1.93
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RTL8BQ17RB0 AC110597.3-202ENST00000583493 3289 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
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RTL8BQ17RB0 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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RTL8BQ17RB0 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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RTL8BQ17RB0 LINC00317-201ENST00000419069 612 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 AL360093.1-201ENST00000420237 1126 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
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RTL8BQ17RB0 VN1R105P-201ENST00000486595 910 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 AC108866.1-202ENST00000511064 573 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
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RTL8BQ17RB0 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 EIF4A2P3-201ENST00000525903 1055 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC2.97□□□□□ -1.93
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RTL8BQ17RB0 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 AC006116.4-201ENST00000589671 452 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 AC006557.3-201ENST00000592926 517 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 ZNF283-207ENST00000593164 1260 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC2.97□□□□□ -1.93
RTL8BQ17RB0 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
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