Protein–RNA interactions for Protein: Q16585

SGCB, Beta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCBQ16585 AC034205.1-201ENST00000520621 638 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 OR5BC1P-201ENST00000529327 739 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AC023796.1-201ENST00000536131 670 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AC125603.1-201ENST00000552718 366 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AP001160.4-201ENST00000596971 382 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AC233280.2-201ENST00000603917 1070 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AL138721.1-201ENST00000616756 179 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 BX649567.1-201ENST00000642071 1134 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 ZNF705A-204ENST00000610508 3378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 PLS3-209ENST00000539310 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC4□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 OR8J3-203ENST00000641913 3047 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 TMEM161BP1-201ENST00000457388 1457 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 NOL8P1-201ENST00000508336 3529 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 MMRN1-204ENST00000508372 3234 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 ALG6-201ENST00000263440 1895 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 PANK1-203ENST00000342512 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 MBNL3-201ENST00000370839 1575 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 TMEM251-201ENST00000283534 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 XIAPP3-201ENST00000312918 795 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 BTBD9-AS1-201ENST00000412822 560 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 COX6CP17-201ENST00000421389 185 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AC096632.1-201ENST00000427395 310 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 MOBP-206ENST00000428261 561 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AL136084.2-202ENST00000433997 353 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AL132765.1-201ENST00000434165 553 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 SLC8A1-AS1-205ENST00000435515 497 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AC011276.1-201ENST00000469688 323 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 RN7SL812P-201ENST00000493791 279 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 STMN1P2-201ENST00000508435 439 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AC002456.2-201ENST00000509356 380 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AC018797.3-201ENST00000513388 1241 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AC092593.2-201ENST00000513866 913 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AC008694.2-201ENST00000517591 306 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AP001207.1-201ENST00000524051 481 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
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SGCBQ16585 AL160290.3-201ENST00000604869 165 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 Z98200.1-201ENST00000607298 470 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 MIR6891-201ENST00000618788 93 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AC092683.2-201ENST00000619740 621 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
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SGCBQ16585 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 CFAP221-215ENST00000598644 1532 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 KLRD1-204ENST00000381908 15549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 SLC17A4-201ENST00000377905 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 ADAM29-214ENST00000618444 2949 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 SEPT7P7-201ENST00000420492 1301 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 STON1-GTF2A1L-203ENST00000402114 3790 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 WAC-221ENST00000628285 2740 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AC090337.1-201ENST00000579651 2074 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AC107953.2-201ENST00000518362 1408 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AL035405.1-201ENST00000400795 710 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 SSXP10-201ENST00000402595 565 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 SKP1P3-201ENST00000429280 487 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 ARL6IP1P2-201ENST00000431356 563 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AC005828.1-201ENST00000431604 524 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 B3GNT2P1-201ENST00000434960 952 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 RPS7P2-201ENST00000435134 607 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AC114495.1-201ENST00000441274 436 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AC010884.1-201ENST00000456519 642 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AC092832.2-201ENST00000456621 389 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 MGAT4A-209ENST00000495056 683 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
SGCBQ16585 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
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