Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 MRPS33P3-201ENST00000513456 322 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 RPL23AP53-201ENST00000521854 457 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 MTND4LP24-201ENST00000572277 291 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC5.9□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 ZNF66-203ENST00000594534 757 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC5.9□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC5.9□□□□□ -1.46
VPS72Q15906 MDN1-201ENST00000369393 18413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 EYA4-202ENST00000355286 4317 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC5.9□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 LMO3-201ENST00000261169 3810 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 RABGAP1L-205ENST00000367687 1849 ntTSL 2 BASIC5.9□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 NRDE2-201ENST00000354366 14208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.9□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 CDR1-201ENST00000370532 2467 ntAPPRIS P1 BASIC5.89□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 ETV1-208ENST00000420159 6231 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 SRSF11-201ENST00000370949 3034 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 RASGEF1B-207ENST00000509081 3016 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AL136164.3-201ENST00000624429 3978 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AC114546.3-201ENST00000623582 1734 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 RNU6-543P-201ENST00000362576 108 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AF240627.1-201ENST00000416002 879 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AL096799.1-201ENST00000425900 381 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AC006369.2-201ENST00000431712 384 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 TCEA1P3-201ENST00000443005 880 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AC003001.1-201ENST00000443247 1135 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AC079203.1-201ENST00000487972 404 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 HPRT1P2-201ENST00000505250 544 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AC097535.1-201ENST00000515263 332 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 SDHAF2-205ENST00000537782 559 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 LINC02386-201ENST00000551202 509 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 LINC02345-201ENST00000557883 766 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AC138907.2-201ENST00000561479 866 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AC145350.4-201ENST00000562827 866 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AC133485.5-201ENST00000563407 866 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 MIR4789-201ENST00000577469 82 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AP001094.1-201ENST00000579805 193 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AC090312.2-201ENST00000582687 378 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 PRPF19P1-201ENST00000584766 898 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 TTN-AS1-245ENST00000592182 749 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AC123768.3-201ENST00000613733 523 ntTSL 3 BASIC5.89□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AC023509.5-201ENST00000617434 807 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 TTN-AS1-267ENST00000628826 662 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 ITGA9-AS1-218ENST00000630762 751 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AC013470.2-206ENST00000636804 771 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 FBXO3-208ENST00000530401 7410 ntTSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 LINC02225-201ENST00000510444 4069 ntTSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 XPNPEP3-201ENST00000357137 7988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 EMCN-209ENST00000511970 1377 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 DYTN-201ENST00000452335 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.89□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 FAM111B-202ENST00000411426 3344 ntTSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AL353743.4-201ENST00000422653 1547 ntBASIC5.89□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 EVI2A-202ENST00000461237 1540 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC5.89□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 KMT2E-216ENST00000622386 1588 ntTSL 5 BASIC5.89□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 USP9YP4-201ENST00000424401 1745 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AC010266.2-201ENST00000564741 3255 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AC106895.2-201ENST00000511291 1824 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 OR1E2-201ENST00000248384 972 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 RNA5SP453-201ENST00000362503 119 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 U6.112-201ENST00000384129 70 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 LINC01208-202ENST00000434969 827 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AC112715.1-201ENST00000445534 350 ntTSL 3 BASIC5.88□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC5.88□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 AL035404.1-201ENST00000497982 568 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
VPS72Q15906 WWC2-AS1-201ENST00000511846 404 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
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