Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 AC087385.1-201ENST00000475062 312 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 NPM1P17-201ENST00000479221 602 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 ZNF131-215ENST00000509931 970 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 OR4C2P-201ENST00000530855 1064 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 AL133166.1-202ENST00000550975 565 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 ETFRF1-202ENST00000553788 708 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 AL109741.3-201ENST00000561748 592 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 AGGF1P8-201ENST00000562979 1000 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 AC016597.1-201ENST00000564893 528 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 LINC01900-202ENST00000584898 603 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 LINC01028-202ENST00000588782 458 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 AL034351.1-201ENST00000605288 668 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 C2orf27A-204ENST00000623058 969 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 AC066616.2-201ENST00000559334 1481 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 OTUD4P1-201ENST00000237841 3067 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 NUFIP2-201ENST00000225388 10850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 AC100871.1-201ENST00000507871 1456 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 RNU1-87P-201ENST00000363727 170 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 RNU6-283P-201ENST00000364788 107 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 TCEAL7-202ENST00000372666 852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 FABP12P1-201ENST00000401911 322 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 AC114814.2-201ENST00000419195 485 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 Z99289.1-206ENST00000425503 393 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 AC066595.1-201ENST00000426697 399 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 BMS1P19-201ENST00000433925 393 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 RRM2P4-201ENST00000441721 562 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 AC092924.1-201ENST00000496084 487 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 AC006063.1-201ENST00000512511 560 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 RANP9-201ENST00000519957 271 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 AC005908.2-201ENST00000546078 530 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 NDUFB1-204ENST00000555441 458 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 AL161713.1-201ENST00000555538 145 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 HAUS1-203ENST00000585518 506 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 AC123768.4-201ENST00000616244 701 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 AC009303.2-205ENST00000627670 1091 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 FOXP2-227ENST00000638397 240 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 PNISR-201ENST00000369239 5112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 ACADM-203ENST00000420607 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 RPS4XP5-202ENST00000449995 1334 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 TNFAIP6-201ENST00000243347 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 EXOC5P1-201ENST00000510543 1969 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 RNA5SP42-201ENST00000364278 115 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 SNORD3H-201ENST00000384486 214 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 AC244033.1-201ENST00000426826 870 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 AL157359.2-201ENST00000440372 784 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 LARS2-AS1-201ENST00000442534 575 ntTSL 4 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 RNA5SP309-201ENST00000516670 106 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 AC013549.2-201ENST00000526953 489 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 STX3-204ENST00000530221 534 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 CLEC7A-212ENST00000533022 625 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 AL355922.1-201ENST00000555624 337 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 AL121576.1-201ENST00000556055 276 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 DISC1FP1-201ENST00000561596 545 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 AC100872.1-201ENST00000577765 501 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 AC135178.3-202ENST00000580537 579 ntTSL 3 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC3.62□□□□□ -1.83
TAF1AQ15573 AC005972.3-201ENST00000606304 481 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.2 ms